ACIDOS NUCLEICOS.

1 ACIDOS NUCLEICOS ...
Author: Ignacio Aranda Cabrera
0 downloads 2 Views

1 ACIDOS NUCLEICOS

2 Componentes de A.N.

3 Componente ácido: Fosfato

4 Componente neutro: azúcarRibosa  ARN Desoxirribosa  ADN

5 Componente básico: bases nitrogenadas

6 Propiedades de las bases nitrogenadasExistencia de dipolos Hidrofobia Disposición coplanar de los átomos.

7 Propiedades de las bases nitrogenadasTautomería Tautomeria ceto-enolica Tautomeria imina-amina primaria

8 Tautomeria en BN lactama-lactimaTautomeria en BN imina-amina primaria

9 La tautomería de A es imina–amina primariaLa tautomería de A es imina–amina primaria. Los tautómeros imina se nombran poniendo un asterisco sobre la letra de la base. T y U muestran tautomería doble lactama-lactima

10 G y C muestran tautomerías imina-amina primaria y lactama-lactimaG y C muestran tautomerías imina-amina primaria y lactama-lactima. Los tautómeros imina se nombran poniendo un asterisco sobre la letra de la base.

11 Propiedades ácido-baseTodas las bases nitrogenadas son bases débiles, pues sus átomos de N, tanto nucleares como extranucleares, se pueden protonar, con valores de pKb comprendidos entre 9 y 10. Como ejemplo representativo, obsérvese la ionización de la adenina:

12 Absorción de la luz ultravioleta

13 Nucleótidos y nucleósidosNUCLEOSIDO = BASE NITROGENADA + AZUCAR NUCLEOTIDO = NUCLEOSIDO + FOSFATO Nucleótidos de interés: AMP, ADP, ATP

14 Correspondencia entre los nombres de bases, nucleosidos, y nucleotidosAbreviatura comun A G U T C Base Adenina Guanina Uracilo Timina Citosina Nucleosido Adenosina Guanosina Uridina Timidina Citidina Nucleotido Adenilato Guanilato Uridilato Timidilato Citidilato (nucleosido-monofosfato, NMP) Ac. Adenilico Ac. Guanilico Ac. Uridilico Ac. Timidilico Ac. Citidilico AMP GMP UMP TMP CMP

15

16 PROPIEDEDES FISICOQUIMICAS DE NUCLEOSIDOS Y NUCLEOTIDOSPropiedades iónicas Formación de complejos Absorción de la luz ultravioleta

17 Nucleótidos como moléculas de reserva energéticaATP GTP

18 Hidrolisis

19 Nucleótidos cíclicos y nucleótidos complejosAMPc GMPc

20 Estructura primaria Niveles estructurales:ESTRUCTURA PRIMARIA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS Niveles estructurales: Estructura primaria

21

22

23

24 Fenómenos químicos en la célulaFormación o rotura espontánea de enlaces débiles Enlaces de hidrógeno Fuerzas de van der Waals ADN: doble hélice Uniones hidrófobas Enlaces iónicos

25 MODELO DE WATSON Y CRICK: FORMA B DEL DNAEl modelo tridimensional de la estructura del DNA fue postulado por James Watson y Francis Crick en Corresponde a la denominada forma B del DNA, la más común en las células y la más estable de todas las formas que puede adoptar un DNA bajo condiciones fisiológicas. Este modelo se basó tanto en las observaciones por rayos X como en las reglas de Chargaff, así como en otros estudios realizados mediante técnicas diversas.

26 La proporción de Adenina (A) = (T). La relación(A/T = 1).La proporción de Guanina (G) =(C). La relación ( G/C=1). La proporción de bases púricas (A+G) es igual a la de las bases pirimidínicas (T+C). (A+G) = (T + C).La relación (A+G)/(T+C)=1. Sin embargo, la proporción entre (A+T) y (G+C) era característica de cada organismo, pudiendo tomar por tanto, diferentes valores según la especie estudiada. Este resultado indicaba que los ácidos nucleicos no eran la repetición monótona de un tetranucleótido. Existía variabilidad en la composición de bases nitrogenadas. 

27 Características que conforman el Modelo estructural de Watson y CrickComplementariedad de las bases nitrogenadas; Geometría de los pares de bases; Antiparalelismo de las dos hebras; Diferencia en la secuencia de ambas hebras; Helicidad y carácter dextroso; Parámetros cuantitativos de la doble hélice; Carácter anfipático y estabilidad de la doble hélice: Situación de los fosfatos y carácter hidrófilo; Coplanariedad, apilamiento de las bases y carácter hidrófobo. Significado biológico: idoneidad para la replicación; Superficies de la molécula: surcos en el ADN.

28

29

30 Desnaturalización del ADNEfecto hipercrómico

31

32

33 ADN-B: ADN en disolución, 92% de humedad relativa, se encuentra en soluciones con baja fuerza iónica se corresponde con el modelo de la Doble Hélice. ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como contraiones, presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 Å de diámetro. Es interesante por presentar una estructura parecida a la de los híbridos ADN-ARN y a las regiones de autoapareamiento ARN-ARN.

34 ADN-C: ADN con 66% de humedad, se obtiene en presencia de iones Li, tiene 19 Å de diámetro.ADN-Z: doble hélice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de bases por giro completo, 18 Å de diámetro, se observa en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas (GCGCGC), debido a la conformación alternante de los residuos azúcar-fosfato sigue un curso en zig-zag. Requiere una concentración de cationes superior a la del ADN-B, y teniendo en cuenta que las proteínas que interaccionan con el ADN tienen gran cantidad de residuos básicos sería posible que algunas convirtieran segmentos de ADN-B en ADN-Z. Las posiciones N7 y C8 de la Guanina son más accesibles.

35

36 FIN

37 https://www.youtube.com/watch?v=VZ8GZRx5_Vk