1 Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del SoftwareCangar: Análisis de genes implicados en cáncer mediante Reglas de Asociación Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del Software

2 De un vistazo Gen 1 Gen 2 Gen 3 Gen 4 Gen 5 Gen 6

3 Introducción El Proyecto Experimentación y validación ConclusionesÍndice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones

4 Introducción El Proyecto Experimentación y validación ConclusionesÍndice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones

5 Introducción Descripción del problema y justificación ObjetivosÍndice Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos

6 Introducción Descripción del problema y justificación ObjetivosÍndice Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos

7 Definiciones y problemaMicroarray Estudio del cáncer

8 Descripción del problemaBase de datos con miles de registros Necesidad de sacar algo en claro Demasiados datos para ser analizados por una persona

9 Justificación Bioinformática Combatir el cáncer

10 Introducción Descripción del problema y justificación ObjetivosÍndice Introducción Descripción del problema y justificación Objetivos

11 Objetivos del proyectoHerramienta capaz de encontrar relaciones entre genes Familiarizarse con los algoritmos genéticos Desarrollo web con HTML5 y CSS. Uso de AJAX y librerías JS

12 Introducción El Proyecto Experimentación y validación ConclusionesÍndice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones

13 Minería de datos y Reglas de AsociaciónÍndice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz

14 Minería de datos y Reglas de AsociaciónÍndice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz

15 Tareas identificadas Redacción de documentaciónLectura de documentación Diseño del algoritmo Programación Reunión Preparación de la defensa Lectura de documentación de herramientas

16 Tiempos empleados

17 Presupuesto Rol Coste por hora Director de proyecto 41.91€ Programador junior 11.98€ Horas de desarrollador junior: Horas de jefe de proyecto: 43.41 Total: €

18 Coste del proyecto Horas de desarrollador junior: Horas de jefe de proyecto: Presupuesto desarrollador junior: * = € Presupuesto Jefe de proyecto: * = € Total: €

19 Objetivos

20 Objetivos II

21 Objetivos III

22 Casos de uso

23 Casos de uso II

24 Casos de uso III

25 Minería de datos y Reglas de AsociaciónÍndice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz

26 KDD

27 Reglas de Asociación Básicas: {gen A, gen B} => {gen C}Cuantitativas: {[1, 2] gen A, [2, 3] gen B} => {[3, 4] gen C}

28 Medidas de calidad

29 Minería de datos y Reglas de AsociaciónÍndice El Proyecto Planificación Minería de datos y Reglas de Asociación Algoritmo e Interfaz

30 Algoritmo genético

31 Algoritmo NSGA-II Frentes de Pareto Distancias

32 Diagrama de Componentes

33 Tecnología usada

34 Interfaz de resultados

35 Grafo de resultados

36 Tabla de reglas

37 Introducción El Proyecto Experimentación y validación ConclusionesÍndice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones

38 Experimentos sobre medidasGrupo 1 Grupo 2 Grupo 3 Soporte Precisión Factor de certeza Apalancamiento Interés Confianza Ganancia Convicción Netconf Yule’s Q Cobertura

39 Rendimiento y distanciasRendimiento en atributos Rendimiento en individuos

40 Resultados obtenidos

41 Heatmap

42 Volcano plot

43 Introducción El Proyecto Experimentación y validación ConclusionesÍndice Introducción El Proyecto Experimentación y validación Conclusiones

44 Conclusiones Algoritmos genéticos muy potentesSe han cumplido los objetivos Necesidad de colaboración entre distintos campos de la ciencia

45 Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del SoftwareCangar: Análisis de genes implicados en cáncer mediante Reglas de Asociación Muchas gracias Alejandro Sánchez Medina Grado en Ingeniería Informática del Software