1 Barcoding las Abejas del Mundo L. Packer, J. Gibbs, CBarcoding las Abejas del Mundo L. Packer, J. Gibbs, C. Sheffield York University.
2 Meliponula bocandei en Kenya
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4 Resumen Qué es ADN ‘barcoding’ y como se hace?Bee-BOL: la campaña para ‘barcode’ las abejas del mundo. Ejemplos de investigaciones: Una entera comunidad de abejas Un taxon entero Datos preliminares para algunos Meliponini iBOL, BEE-BOL y lo que usted puede hacer para ayudar: requisitos y beneficios.
5 The Mitochondrial GenomeDNA Barcoding – Animal target gene – part of COI The Mitochondrial Genome DNA Small ribosomal RNA D-Loop Cytochrome b ND6 Typical Animal Cell ND2 COI mtDNA L-strand Target Region ADN mitochondriale porque existen en multiple copias in todas las cellulas de cuerpo H-strand COII COIII Mitochondrion
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7 Biodiversity Institute of Ontario - Infrastructure - 2008Equipo, un mitad de edificio, pero ahoy as lleno y un otro edificio dedicado totalmente a barcoding es necessario
8 Specimen Imaging and DatabasingCuando llegan especímenes, los datos de colección son registrados en una base de datos y el espécimen es fotografiado. 8
9 Specimen Tissue SamplingLe porcion por abejas es uno de las piernas mesosomaticas, algunas veces – por los mas piquenas de individuales es necessario a tomar todo los piernas de un lado. Una pequeña porción del espécimen se toma para la extracción de ADN. Esto es incubado durante la noche en una mezcla de químicos que rompen la estructura de las células y las proteinas. 9
10 Bee Barcoding Sample Testing MethodologyMethods York 6 boxes – 516 specimens from 28 nations Ninety-six well DNA isolation protocols Hierarchy of primer decisions; including degenerate primer cocktails % success amplifying barcode sequence Emplacar la pierna en un poco tubo, despues isolacion de ADN, despues amplificacion de ADN, y finalmente sequence?? Los sequences estan analysada por un methodologia phenetica – neighbour joining – no es un arbol phylogenetica, solamente Un arbol de simularidad
11 Inaugural Meeting Reunión Inagural Reunião Inaugural 創立総会Barcoding the Bees of the World "Barcoding" las Abejas del Mundo "Barcoding" das Abelhas do Mundo 世界の蜂バーコーディング Tenemos un reunion en canada en mayo de esta ano Inaugural Meeting Reunión Inagural Reunião Inaugural 創立総会 May 12th – 14th – 14 Mayo, 2008 12 – 14 Maio, 2008年 5月12-14日
12 Aqui los participantes – totalmente feliz con un excepcion – me – lo siento por los organizadores, es trabajo dificil!
13 BeeBol: 6 submitted plates: 423 sequences423/561 with some sequence (75%) ~1200 sequencing reactions 235 with >600 bp 85 with < 400 bp Taxonomic patterns 6 families, 76 genera Age patterns 6 boxes 297 P1 (LepF1/LepR1) 215 P2 (LepF1/C_ANTMR1D) 130 P3 (RonMWASPDeg_T1/LepR1) 85 P3 (MLepF1/LepR1) Folmer primers (not tried on these specimens) 10 Wolbachia CO1 sequences that amplified with P1 All produced insect CO1 with P2 and P3 3 mouse sequences Taq contamination Por la reunion, muchos de los participantes enviar me piernas de abejas por barcoding, por muchos los resultos esta bien, Pero los insectos qui restan en un museo con condiciones de humidade los resultos disminuye.
14 BeeBol – – comparación dentro de taxaDentro de una especie (según la definición original) Entre especies hermanas Arriba differencias intraspecificos Resultas typicas, predominamente differencias entre especias es menos de 2 porcent, aqui una especie estan mas de una especie, especias crypticas 14
15 BeeBol– Longitud versus edadLos resultos esta bien para insectos mataran menos de diez anos, pero informacion util es possible con individuales de venty anos.
16 BEE STATS – de hace cinco mesesEste es el distribucion geografica de dados de hace cinco meses, hay mucho mas informacion ahora. Tenemos mas barcodes desde Mexico de en toda de Europa y toda de Australia en combinacion. 5,643 Barcodes 1,490 Especies Barcoded 375 Andrenidae 1,376 Apidae 243 Colletidae 2,137 Halictidae 690 Megachilidae 8 Melittidae
17 El Bee-BOL Website Ha sido inaugurado.: www.bee-bol.orgUsted puede encontrar Todas las presentaciones 'powerpoint' o 'read texts' de la reunión Todas las presentaciones de el ‘Pollinator Summit’ en Durban a principios de julio Documentos de la reunión, incluyendo sugerencias de como usted puede ayudar. La lista de las especies de abejas del mundo, con cada especie relacionada a su página en el website ‘Discover Life’ Lista de colaboradores, información de contactos, lista de proyectos etc. Esta presentación (a mediados de octubre) Y en addicion, tenemos imagens de abejas lindas en el sitio.
18 The Bee-BOL website Es simple pero
19 Un estudio de una comunidad entera: las abejas de Nueva Escocia, CanadaCory Sheffield 2% Hylaeus affinis / modestus Hylaeus affinis / modestus Hylaeus basalis Hylaeus annulatus Hylaeus mesillae Hylaeus verticallis Colletes compactus Colletes inaequalis Es un exemplo de un arbol de mas de cien quarenta especies, todas las especies is differenciable por barcoding con un excepcion – pero es un complejo de especies – qui es identicale en morfologia, pero completamente differente en el barcode. Colletes simulans Macropis nuda Perdita octomaculata Colletidae
20 Dialictus: ADN barcoding una pesadilla de taxonJason Gibbs
21 En america del norte tenemos dos cien cinquenta de especies con el apparencia mas o menos identicale – esos es el mismo Especie – actualmente el mismo individual repetitido, pero un imagen con especies differentes estan muy simular de eso.
22 Resultados: Tipo 1 ~ 70% Un acuerdo evidente entre morfología y datos moleculares Poca variación dentro especies a lo largo de grandes areas geográficas Morfologia y barcoding debe el mismo informacion, 70 por cent de exemplares es de esta typo. 22
23 Resultados: Tipo 2 ~ 12% Grandes divergencias dentro una ‘sola’ especie Sinonomias equivocadas Especies crípticas These two species had been incorrectly synonymised 23
24 Grupo tegulare del esteL. surianae vuelve L. tegulare parafilético Dos especies son resucitadas (L. ellisiae y L. lepidii) Dos nuevas especies (L. carlinvillense y L. puteulanum) L. tegulare This is a proper phylogenetic analysis of a set of sequences, everything below surianae on the tree had been referred to as a single species – tegulare, again, two of the other names had been described and then synonymised, two new species were discovered. All of these species can be differentiated – mostly based upon very subtle morphological characters 24
25 Resultados: Tipo 3 ~ 15% Asociaciones entre los sexosNuevas sinonomias The sexes of these species had not been previously associated – note the male and female assignations 25
26 Resultados: Tipo 4 ~ 3% Distintas morfologías Pero la misma secuencia!L. rohweri y L. callidum There are two examples of this out of 150 species. It is possible that the differences related to queen and worker castes of the same species as there are often more morphological differences between castes of the same species than between queens or between workers of sister species in this group 26
27 Nido de Dactylurina en Nairobi
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29 iBOL Objetivo de Financacion (5 Años ) Nódulos Centrales > $15M por nódulo Nódulos Nacionales > $1M por nódulo Nódulos Regionales > $5M por nódulo Objetivo de Financacion Total $150M iBOL Objetivo de Financacion (5 Años ) Tenemos un applicaction para financacion desde el gobierno de Canada para 25miliones de dolares, Probablements si es es SUCCESSFUL es posible que tengo bastante por barcoding de 10,000 abejas individuales Los resultos serian conocidas en avril de 2009. 10 especímenes de cada una de 500,000 especies, dentro de 5 años de activación Esperamos ‘barcode’ todas las abejas por ~$5M. 29
30 Requisitos y BeneficiosEspecímenes para ser ‘barcoded’ tienen que: Tener datos completos de la colección Tener por lo menos una imagen asociada por especie Por lo menos un ejemplar de cada especie tiene que estar guardado en una institución que lo puede prestar, si estudios morfológicos adicionales son necesitados Todo material puede ser regresado a su país de origen Beneficios Datos Identificaciones Publicaciones asociadas con series de datos completos Entrenamiento, asistencia a talleres/conferencias para estudiantes
31 PARTNERS IN FUNDING AND IN-KIND SUPPORTThe Gordon and Betty Moore Foundation, Natural Sciences and Engineering Research Council (Canada), Canada Research Chairs program, Ontario Foundation for Innovation and Genome Canada through the Ontario Genomics Institute to PDNH Fonds québécois de la recherche sur la nature et les technologies B3 postdoctoral fellowship to MAS. CBOL – funded the May workshop York University Sujeevan Ratnasingham (BOLD) Kate Crosby and Anibal Castillo (diligent, careful and enthusiastic lab work) Claudia Ratti y su madre para translacion. COLLABORATIONS John Ascher and John Pickering and others that contributed to the bee species list on Discover Life Sam Droege All workshop attendees who submitted samples Numerous collaborators throughout the world who have sent in samples
32 Muchas Gracias Un Meliponario en Kenya