CAPÍTULO 4. FUENTES DE DATOS EN

1 CAPÍTULO 4. FUENTES DE DATOS ENANTROPOGENÉTICA Bases de...
Author: Agota Cuba
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1 CAPÍTULO 4. FUENTES DE DATOS ENANTROPOGENÉTICA Bases de datos del Genoma Humano. Bases de datos de frecuencias y secuencias. Datos lingüísticos, arqueológicos y paleontológicos.

2 Bases de datos del Genoma humanoLa mayor parte de la información acerca de genomas que es interesante en Antropogenética, se encuentra en la página del NCBI (National Center for Biotechnology Information), (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) incluyendo:

3 Bases de datos del Genoma humanoGenBank. Para cualquier región del genoma, bibliografía, secuencias, SNPs asociados, primers, algunas frecuencias

4 Bases de datos del Genoma humanoDatabase of Short Genetic Variations (dbSNP). La base de datos de SNPs, donde podemos encontrar bibliografía, mapas, secuencias, etc.

5 Bases de datos del Genoma humanoUniSTS. En esta sección se puede encontrar información sobre microsatélites: posición, cebadores PCR, bibliografía.

6 Bases de datos del Genoma humanoOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM). Información exahustiva sobre todas las enfermedades con un origen genético.

7 Bases de datos del Genoma humanoBase de datos de Genotipos y Fenotipos. Podemos encontrar genes, SNPs asociados y trabajos con resultados significativos para un gran número de caracteres, patológicos o no.

8 Bases de datos del Genoma humanoHay diferentes secciones en función de los tejidos, órganos, etc.

9 Bases de datos del Genoma humanoDatabase of Major Histocompatibility Complex (dbMHC). Información de diversa índole sobre el Complejo Mayor de Histocompatibilidad.

10 Bases de datos del Genoma humanoPubMed. Para una búsqueda exahustiva de bibliografía en revistas con índice de impacto. Si el manuscrito es accesible, aparece un enlace a la revista.

11 Bases de datos del Genoma humanoNCBI - Bookshelf. Ediciones electrónicas de algunos libros interesantes.

12 Bases de datos del Genoma humanoBLAST. Busca secuencias determinadas en el genoma humano o de chimpancé, entre otros.

13 Bases de datos del Genoma humanoTambién permite diseñar cebadores para una secuencia concreta.

14 Bases de datos del Genoma humano* Population is made of family trios HapMap (http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/). La base de datos HapMap surgió de un consorcio de varios centros de investigación de varios países. Se encuentran almacenadas los genotipos de una gran cantidad de SNPs de más de 1000 individuos de diferentes continentes, así como algunas informaciones complementarias.

15 Bases de datos del Genoma humano1000 genomes(http://www.1000genomes.org/). La base de datos 1000 genomas incluye la secuencia completa de todos los SNPs de más de 1000 individuos de diferentes continentes.

16 Bases de datos de frecuencias y secuenciasALFRED, ALlele FREquency Database (http://alfred.med.yale.edu/alfred/) Incluye frecuencias de alelos de genes, SNPs, inserciones Alu, STRs, etc. para un gran número de poblaciones

17 Bases de datos de frecuencias y secuenciasYHRD, Y Chromosome Haplotype Reference Database (http://www.yhrd.org/) Base de datos de STRs y SNPs del cromosoma Y

18 Bases de datos de frecuencias y secuenciasMITOMAP A human mitochondrial genome database (http://www.mitomap.org/) Base de datos sobre el ADNmt. Incluye la secuencia consenso, mutaciones específicas de continentes, frecuencias por subcontinentes, referencias y enlaces a la base de datos de las secuencias completas individuales del NCBI.

19 Bases de datos de frecuencias y secuenciasPueden conseguirse secuencias individuales completas de ADNmt a través del NCBI

20 Bases de datos de frecuencias y secuenciasSTR Data Base. Short Tandem Repeat DNA Internet DataBase (http://www.cstl.nist.gov/div831/strbase/index.htm) Información exahustiva sobre los STRs del sistema CODIS principalmente, con primers, bibliografía y varias fuentes de frecuencias. También hay algunos programas útiles.

21 Bases de datos de frecuencias y secuenciasFrecuencias HLA. (http://www.allelefrequencies.net/) Frecuencias alélicas y haplotípicas de genes HLA

22 Datos lingüísticos, arqueológicos y paleontológicosEthnologue. (http://www.ethnologue.com/) Base de datos con todos los idiomas del mundo, incluyendo su distribución y clasificación.

23 Datos lingüísticos, arqueológicos y paleontológicosWikipedia. Lista de grupos étnicos.

24 Datos lingüísticos, arqueológicos y paleontológicosLa base de datos de Howells tiene medidas craneales de poblaciones de todo el mundo.

25 Datos lingüísticos, arqueológicos y paleontológicosADAM. Base de datos de medidas osteológicas de diferentes yacimientos. Recopila una gran cantidad de datos de los yacimientos y medidas de los restos en excavaciones arqueológicas de diferente antigüedad.