1 Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011 Herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for- use) de los datos de biodiversidad Manuel Vargas Del Valle ([email protected]) Coordinador de la Unidad de Desarrollos Informáticos Instituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio) Buenos Aires (Argentina) 30 septiembre 2011

2 Resumen Esta presentación es una recopilación de herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for-use) de los datos sobre biodiversidad. Esta charla es una traducción de la elaborada en inglés por Nicolas Noé y Meherzad Romer, y traducida también al francés por ellos mismos.

3 Contenidos Herramientas para metadatos Herramientas para datos espaciales Herramientas para datos tabulares Fuentes de datos Documentos

4 Herramientas Metadatos

5 IPT (y Dwc-A) http://code.google.com/p/gbif-providertoolkit/

6 Geographic coverage metadata in IPT IPT (y Dwc-A) http://code.google.com/p/gbif-providertoolkit/

7 Darwin Core Archive Validator http://tools.gbif.org/dwca-validator/

8

9 Herramientas Datos espaciales

10 GeoLocate http://www.museum.tulane.edu/geolocate/ Carga de datos individual o en lote Visor con varias capas Pueden hacerse correcciones moviendo la localidad o dibujando un polígono Se pueden añadir comentarios, ignorar registros y corregir registros similares Versiones para Internet, escritorio y trabajo colaborativo

11 InfoXY http://splink.cria.org.br/infoxy?criaLANG=en Recibe coordenadas en lat/long Puede realizar procesamiento s en lote Salida: html o MS Excel

12 spOutlier http://splink.cria.org.br/outlier?&setlang=en

13 spOutlier

14 Calculadora de georreferenciación Entrada: Coordenadas, desplazamientos y distancias, fuentes de incertidumbre Devuelve: Coordinates Estimados de error

15 Diva-GIS http://www.diva-gis.org/ Software SIG básico Gratuito Orientado a biología Vectorial/Ra ster Compatible con muchos formatos

16 Quantum GIS http://www.qgis.org Software SIG de propósito general Libre Acepta capas geográficas de Bds y servicios web Mac/Linux/Window s Vectorial/Raster Extendible con Python Systema de agregados Comunidad de desarrolladores

17 R http://www.r-project.org Lenguaje y ambiente de desarrollo para estadística. Análisis y graficación. Extendible e integrable con muchas otras aplicaciones libres: SIG, otros lenguajes, ecología, etc.

18 Herramientas Datos tabulares

19 Separador (parser) de nombres Atomiza nombres científicos

20 “Separador de nombres”

21 Buscador de nombres http://tools.gbif.org/namefinder/ Encuentra nombres científicos Entradas: Archivo URL Texto libre

22 Buscador de nombres

23 Marcador de taxones Entradas: Url PDF

24 Marcador de taxones

25 Checklist Bank Output: Higher taxonomy Input: Scientific Names

26 Darwin Test

27 Mapas fáciles de hacer Mantiene datos en línea Tables de Fusión de Google

28 “Scripting”/lenguajes dinámicos...y el viejo SQL

29 Fuentes de datos

30 OpenStreetMap "Wikipedia de mapas" http://www.openstreetmap.org

31 Thesauri “Checklists”: o Peces : Fishbase o Animales: Index to Organism Name (ION) o Mamíferos: Mammal Species of the World (MSW) o Bacterias: List of Bacteria with Standing in Nomenclature (LBSN)...

32 Documents

33 Informe de situación de GBIF Planes y recomendaciones para mejorar la aptitud de uso de los datos en la red de GBIF http://www.gbif.org/orc/?doc_id=27 77

34 Inventario BDQ de GBIF de España http://www.gbif.es/BDQ.php

35 Centro de recursos en Internet de GBIF http://www.gbif.org/orc/

36 Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011 Herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for- use) de los datos de biodiversidad Manuel Vargas Del Valle ([email protected]) Coordinador de la Unidad de Desarrollos Informáticos Instituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio) Buenos Aires (Argentina) 30 septiembre 2011