1 Diseño de Fármacos Virtual Screening Escuela de QuímicaDepto. de Fisicoquímica Unidad de Química Computacional Letona R, Velázquez O.

2 ¿Cómo creen que se desarrollan nuevos fármacos?

3 Productos Naturales con BioactividadSe sabía que una planta curaba Se buscaba extraer extractos Se probaba in vitro, in vivo Se elucidaba la estructura Se sintetizaba

4 Screening (Tamizaje) HTS (Highg Throughput Screening) uHTS (ultra HTS)VS (Virtual Screening)

5 ¿Y eso cómo funciona? ¿Cómo?

6 Obtención de Datos NMR Difracción de rayos X ab initio Doblamiento

7 Representación 2D 3D Coordenadas Secuencia protéica

8 Cálculos / Evaluación Posing Scoring Ranking

9 Colocación (Posing) Algoritmo Genético (o Evolutivo)Algoritmo Aleatorio Método MonteCarlo

10 Evaluación (Scoring) Campos de Fuerza Semiempíricos Mecánica Cuántica

11 Clasificación (Ranking)Resultados de Energía Método Metrópolis Criterios Alternativos

12 Dinámica Molecular Proceso lento Utiliza ecuaciones de NewtonCálculo fino

13 Docking Proceso rápido Utiliza alguno de los algoritmos anterioresCálculo moderado

14 QSAR Quantitative Structure Activity RelationshipProceso más rápido Utiliza topología y redes Predice actividad específica

15 Propiedades FisicoquímicasLa mayoría se obtienen en el momento Se utilizan diferentes principios y algoritmos Se piensa en síntesis y en propiedades ADME/T (Lipinski)

16 Diseño de novo Proceso más lento de todosUtiliza una combinación de los métodos y algoritmos anteriores Diseña nuevas moléculas de la nada o derivatizando una ya existente

17 ¿Con qué lo hago? ¿Cómo lo uso?

18 Bibliotecas De proteínas De fármacos De moléculas en generalLibres/Comerciales

19 Software Representación Mecánica Molecular Mecánica CuánticaDinámica Molecular Docking QSAR Automatización de procesos (pipelining) Libre/Comercial

20 Literatura Artículos científicosRevistas científicas dedicadas (solo a eso) Libros

21 Hardware Cluster Grid GPU Su compu :o)

22 ¿Qué se puede hacer con ello?

23 Bioquímica Antirretrovirales (Tipranavir)Inhibidor de la producción de ácido (Esomeprazol) Anti-Alzheimer (derivados de ampakinas) Solo es de investigar qué proteína activa/inhibe

24 Antecedentes Antirretrovirales Anti-Alzheimer Nano-encapsulamientoUnidad de Química Computacional

25 Esperamos sean parte del futuro …Muchas gracias