1 GENETICA 2011 PARTE II: HERENCIA Teorica 7

2 MAPA DE LIGAMIENTO DEL CR 1 HUMANO Un valor de 1 % de recombinación o entrecruzamiento significa que los genes están ubicados a una distancia expresada en una unidad llamada centimorgan o una unidad de mapa del mismo cromosoma

3 COMO SABER SI GENES ESTAN LIGADOS? PROGENIE RECOMBINANTE Y NO-RECOMBINANTE

4 A1 y A2 son 2 posibles marcadores de la enfermedad

5 En que orden están los genes en un mismo cromosoma? Cruzamientos de 3 puntos Datos: 3 loci ligados (abc). La combinacion menos frecuentes sera la q requiera 2 eventos de CO De 1000 descendientes: 142 sufrieron CO entre a y b.52 sufrieron CO entre a y c 100 sufrieron Co entre b y c 5 sufrieron CO entre a y c

6 ENTONCES: El orden de los genes es a-c-b Las distancias aproximadas son: a (5cM)-c-(10cM)-b

7 MARCADORES MOLECULARES GENOTIPOFENOTIPO GENES AMBIENTE

8 MARCADORES MOLECULARES RFLP VNTR RAPDs STRs AFLP Permiten evidenciar variaciones en la secuencia de ADN entre 2 individuos distintos y asociarlos con un rasgo fenotipico Deben ser: Altamente polimorficos No epistasicos Poco efecto ambiental

9 ANTES DE SEGUIR, PREGUNTAR: SABEN LO QUE ES PCR?

10 RAPDs

11 AFLP

12 LOS MARCADORES MOLECULARES SE PUEDEN CONVERTIR EN MARCADORES “PCR ALELO ESPECIFICOS” (STS: sequence tagged sites) (economicos, robustos, sencillos) Se aisla fragmento polimorfico de un gel Se clona Se secuencia Se disenan primers para esas secuencias EST: expressed sequence tags

13 STS (sequence-tagged sites) y EST (expressed sequence tags) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?term=dbEST

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15 NCBI de USA (GenBank) EBI de EU (EMBL Nucleotide Seq database) DDBJ de Japon SwissProt BASES DE DATOS GENERALES BIO-INFORMATICA

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17 BUSCADOR ENTREZ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquerywww.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery

18 ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi