1 Habilidades para la búsqueda de información biomédicaIñaki Gutiérrez Ibarluzea Servicio de Evaluación de Tecnologías Sanitarias (Osteba) Departamento de Sanidad - Gobierno Vasco
2 Objetivos del taller Dotar a los participantes de los conocimientos teóricos y de las habilidades prácticas necesarios para elaborar estrategias de búsqueda de información relevante, que resuelvan lagunas de conocimiento específicas en biomedicina
3 Objetivos del taller Aprender a elaborar preguntas de búsqueda pertinentes. Conocer la estructura básica de la información recogida en las diferentes bases de datos. Aprender a seleccionar y priorizar bases de datos informáticas dependiendo de la pregunta de búsqueda. Diseñar y testar estrategias de búsqueda adaptadas a las necesidades de información. Realizar un análisis de relevancia de las información recuperada. Apreciar las limitaciones de la exhaustividad y la importancia de la precisión en una búsqueda bibliográfica en biomedicina.
4 Material curso Manuales: Tripdatabase, Pubmed, Cochrane, Enlaces, ETESA. Hojas de elaboración de preguntas y traducción al lenguaje documental y hoja de enumeración de bases de datos
5 Necesidad de informaciónUna información adecuada y de calidad es la base de las decisiones a todos los niveles: - Investigación básica - Planificación de estrategias - Gestión de programas - Desarrollo de actividades preventivas
6 Problemática en la Recuperación de Información ActualizadaAumento de la documentación científica (information overload) Nuevas fuentes de información Revistas con resúmenes estructurados y comentarios clínicos Revisiones sistemáticas: Cochrane Library Acceso a Bases de Datos Bibliográficas
7 Otros problemas en la utilización de la información científicaManejo de la información Sesgo de publicación Barreras idiomáticas Calidad de los estudios Integración de los resultados Actualización de los datos Dispersa ampliamente/poco indizada La búsqueda ideal es una perdida de tiempo salvo en investigación básica No es posible saber que hemos encontrado todo
8 Gran volumen de información disponibleSólo en biomedicina: más de revistas Medline: 16 millones de citas 4 millones desde 1993 citas nuevas por mes > revistas
9 “If a man will begin with certainties, he shall end in doubts; but if he will be content to begin with doubts, he shall end with certainties” Francis Bacon in “The advancement of learning” (1605)
10 ¿Qué? Búsqueda ¿Cómo? ¿Cuánto? ¿Dónde?
11 Búsqueda inicial Tengo un paciente hipertenso ¿Lo trataría con fármacos para prevenir un infarto cerebral?
12 Pasos en el desarrollo de una búsqueda
13 1-Formular una pregunta clínica o el tema a investigar 2-Identificar las bases de datos adecuadas 3-Definir la estrategia de búsqueda (adaptarnos a la base de datos) Dividir la pregunta en términos de búsqueda Determinar los operadores booleanos Usar el tesauro o vocabulario controlado adecuado 6-Depurar la búsqueda si fuera necesario 5-Analizar críticamente los resultados 4-Realizar la búsqueda 7- Contestar a la pregunta
14 1-Formular una pregunta clínica o el tema a investigar
15 “Quien no sabe lo que busca, no puede interpretar lo que encuentra”.Es preferible acometer una evaluación aproximada de una buena pregunta que elaborar la respuesta exacta a una mala pregunta (Feinstein)
16 “La pregunta bien formulada”:. Intervención o exposición . condición de interés . población . outcomes (resultados)
17 Escenario Diagnóstico Pronóstico Etiología Tratamiento o prevenciónImpacto económico
18 Formular el problema
19 Ejemplo
20 ¿El tratamiento farmacológico de la HTA previene los infartos cerebrales?
21 En nuestra pregunta
22 Traducción al lenguaje propio de la base de datosQue no al tesauro, ni a descriptores
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27 2-Identificar las bases de datos adecuadasHay veces que esta elección es imposible ya que simplemente tenemos una base de datos accesible por lo cual nos tenemos que conformar.
28 ¿Qué es una base de datos?Colección organizada de registros de información ¿Qué es una base de datos electrónica? Colección organizada de registros de información a la que se puede acceder de forma electrónica
29 Bases de Datos BibliográficasRegistros = Referencias = Records Campos = Fields Vocabulario controlado = Tesauro
30 Registro / Referencia NO : 1AU : Bohle B;Schwihla H;Hu HZ;Friedl-Hajek R;Sowka S;Ferreira F AD : Department of General and Experimental Pathology,University of Vienna, Austria TI : Long-lived Th2 clones specific for seasonal and perennial allergens can be detected in blood and skin by their TCR-hypervariable regions. SB : A M X LA : ENG SO : J Immunol Feb (4). P MH : Allergens:*BL/*IM. Hay Fever:BL/*IM. Receptors,Antigen,T-Cell *AN/GE. Rhinitis,Allergic,Perennial:BL/*IM. Skin:CH/CY/*IM. Th2 Cells:*IM. Base Sequence. Check Tags:Adult. Human. AB : We investigated the longevity of allergen-specific Th cells derived from patients suffering from either allergic rhinitis or atopic derma titis PT : JOURNAL ARTICLE IS :
31 ¿Cómo elegir una base de datos?Disponibilidad real o económica Especificidad temática (Cancerlit, AIDsLit,..) Si son genéricas (EMBASE o Medline) conviene buscar en las dos Muy importante que tengan lenguaje propio de conceptos (tesauro) Cuente con información a texto completo
32 Bases de Datos Bibliográficas BiomédicasMEDLINE EMBASE HealthSTAR Indice Médico Español Cochrane Library Lilacs Pascal Biosis
33 MEDLINE National Library of Medicine (NLM) Biomedicina 1950-4.600 revistas Actualización semanal Tesauro : MeSH Varias formas de acceso (Pubmed, Grateful Med,…) de citas
34 EMBASE Elsevier Biomedicina y Farmacología 1974- 4.100 revistasActualización semanal Tesauro : EMTREE de citas
35 Solapamiento entre MEDLINE y EMBASE1.600 25.8% 2.500 40.4% 2.100 33.8% EMBASE MEDLINE
36 Indice Médico Español CSIC Artículos de revistas biomédicas españolas1971- 321 revistas Descriptores registros
37 Cochrane Library Colaboración Cochrane 1992-Revisiones sistemáticas de ECA Actualización trimestral Descriptores y MeSH De libre acceso en el estado español Actualmente colaboración iberoamericana
38 Bases de datos electrónicas aspectos positivos y negativos+ - Fácil acceso Mejora edición Inclusión de abstracts Sólo 6000 revistas Localización de ECC dificultosa Aprox, 60-70% de ECC identificados * En España se pierde una tercera parte de ECC sólo usando Medline
39 Clasificación de los recursos electrónicosFuentes bibliográficas Bases de datos libres - revistas: referencias & abstracts (raramente texto completo) Bases de datos mediante subscripción Catálogos de bibliotecas - título y a veces comentarios sobre el contenido
40 Fuentes electrónicas Fuentes de texto completoWebs de MBE y guías de práctica clínica Publicaciones de ETS Publicaciones gubernamentales/oficiales Asociaciones profesionales Listas y subscripciones de correo electrónico Búsquedas generales por internet Revistas que permiten acceso a texto completo
41 Bases de libre acceso (Medline y otras) Pubmed CancerlitCochrane Library plus Databases del CRD - (DARE, NHS EED, HTA) Lilacs (revistas iberoamericanas)
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43 Literatura gris La que se produce en niveles altos de la administración, académicos, de negocios y en la industria. Formato electrónico o impreso. No controlada por las grandes empresas de publicación. No convencionales y muchas veces efímeras
44 Organismos gubernamentales u oficiales (literatura gris)Programas y políticas de salud Muchos documentos a texto completo Acceso a estadísticas y datos de supervivencia Muchos nuevos accesos menores con datos de interés
45 Algunos sitios oficiales o gubernamentales de interésHealth Canada US Centers for Disease Control World Health Organisation UK Department of Health US National Cancer Institute Australian Dept Health & Aged Care Instituto de salud Carlos III
46 Algunas fuentes de literatura grisThe New York Academy of Medicine
47 Internet en general Menor eficienciaEvaluar la autoridad (.ac .edu .org) Conviene leer las indicaciones previamente Sólo usar cuando se agotan otras busquedas Gran ayuda en los buscadores locales De gran utilidad para la literatura gris
48 Buscadores Usar el formato que aparece en la otra columna.com Google Altavista Northernlight Yahoo (regional) Metacrawler Dogpile
49 Nuevos buscadores en construcciónLa biblioteca del NHS del Reino Unido NeHL National electronic Library for Health
50 Bases de Datos de la National Library of Medicine indizadas con Medical Subject Headings (MeSH)AIDSLINE: Literatura sobre SIDA AVLINE: Materiales audiovisuales para profesionales de la salud BIOETHICS: Literatura sobre ética biomédica CANCERLIT: Literatura sobre cáncer HealthSTAR: Planificación y gestión sanitaria MEDLINE: Literatura biomédica TOXLINE: Literatura sobre toxicología
51 Servidores de información ($)OVID SilverPlatter EMBASE.com Trip de pago
52 METABUSCADORES Facilitar al máximo y hacer más eficiente la búsqueda de información. Buscando en múltiples sitios y entregando un resumen de los artículos relevantes acerca del tema que se solicitó. Diferencia entre ellos es la forma de buscar, los lugares en que buscan y como presentan la información.
53 METABUSCADORES Información y guías en castellano en:
54 3-Definir la estrategia de búsqueda
55 Definir la estrategia de búsquedaSeparar la pregunta en conceptos que puedan ser buscados por separado y combinados
56 Determinar los operadores booleanos
57 Determinar los operadores booleanosAND, OR, NOT Stomach neoplasm AND Chemotherapy, adjuvant survival Operadores de adyacencia o proximidad (adj)
58 Otros operadores El truncamiento (* o $)recombin*: recombinant, recombination,.. Uso de parentesis (((adjuvant chemotherapy or antineoplasic agents) and stomach cancer) or gastric cancer)
59 Hypertension AND (treatment OR drugs) AND prevention AND strokeEn nuestra pregunta Hypertension treatment drugs Prevention stroke Hypertension AND (treatment OR drugs) AND prevention AND stroke
60 Utilizar el tesauro apropiado o el vocabulario controlado
61 Tesauro Vocabulario controlado de términos que tienen entre ellos relaciones y que se aplican a un campo concreto del conocimiento. Descriptores : términos que pueden utilizarse en la indización. No descriptores: términos prohibidos que remiten siempre a un descriptor.
62 Tesauro o Vocabulario controladoEn MEDLINE: MeSH y “limitadores” En EMBASE: EMTREE En otras bases de datos: Descriptores
63 Importancia del TesauroDiccionario especial Se utiliza un término para cada concepto simplifica la búsqueda elimina la utilización de sinónimos (teóricamente) recupera términos más específicos (calificadores) DeCS Hipertensión AND (tratamiento OR fármacos) AND prevención AND infartos cerebrales
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65 Hypertension AND antihypertensive agents AND cerebrovascular accident4-Realizar la búsqueda Hypertension AND antihypertensive agents AND cerebrovascular accident
66 Consideraciones MeSH MeSH Tree Major Headings Details SubheadingExplode
67 5-Analizar críticamente los resultados
68 Valorar críticamente los resultadosAnalizar relevancia de los documentos recuperados Relación documentos recuperados que responden a nuestra pregunta frente a documentos recuperados totales (especificidad) Los artículos no responden a mi pregunta Pocos artículos recuperados (o ninguno) Muchos artículos recuperados
69 6-Depurar la búsqueda si fuera necesario
70 Los resultados no sirven para contestar la pregunta formuladaNo se han escogido bien los términos del tesauro La combinación de los términos no es correcta
71 Sinónimos Considerar el uso de sinónimos, o términos de texto libreConsiderar sufijos, prefijos, “comodines” (truncamientos)
72 Importancia del uso de sinónimos o texto libreRecuperar palabras no indizadas que aparecen en títulos o resúmenes Combinarlas con lenguaje controlado para validar nuestra búsqueda
73 Pocos artículos recuperados (o ninguno)Revisar que los términos empleados estén bien escritos. Intentar identificar otros términos, sinónimos de los utilizados, que sirvan para combinarse entre ellos mediante el operador OR Buscar un término de tesauro más genérico que el utilizado No utilizar calificadores Aumentar la sensibilidad de la búsqueda
74 “Muchos” artículos recuperadosTratar de identificar un descriptor adicional y relevante que se pueda combinar mediante el operador AND Identificar elementos combinados mediante AND que podrían combinarse mediante un operador de adyacencia o proximidad Identificar términos más específicos en el tesauro (por ejemplo cerebral infarction en vez de cerebrovascular accident en el tesauro EMTREE)
75 “Muchos” artículos recuperados (cont.)Añadir al descriptor de tesauro un calificador (por ejemplo: stomach cancer/Drug therapy ) Limitar la búsqueda a un campo concreto Utilizar los límites permitidos por la base de datos Utilizar un filtro de búsqueda
76 Considerar el uso de limitadoresAlgunas bases de datos permiten limitar la búsqueda a: tipo de artículo, idiomas sexo grupos de edad etc.
77 Filtros de búsqueda
78 Buscan investigaciones de calidad metodológicaFILTROS: ¿Qué son? Estrategias de búsqueda predefinidas para identificar estudios de la mejor calidad de evidencia Buscan investigaciones de calidad metodológica Eliminan las débiles Los filtros metodológicos son estrategias de búsqueda predefinidas desarrolladas específicamente para identificar y recuperar los estudios de la mejor calidad de evidencia, independientemente del tema que traten, dentro del total de la literatura indexada en las principales bases de datos biomédicas. Es decir, están diseñados y testados para buscar investigaciones de calidad metodológica y eliminar las débiles. Los filtros se componen de términos indizados relacionados con el tipo de estudio y términos específicos asociados con la descripción metodológica de un buen diseño.
79 FILTROS: Tipos Para cada tipo de pregunta clínica: Terapia DiagnósticoPronóstico Etiología y riesgo Daño Revisiones sistemáticas Evaluación económica Existen diferentes filtros para cada tipo de pregunta clínica: Filtros sobre terapia: seleccionan específicamente ensayos clínicos controlados, especialmente estudios randomizados y doble ciego. Filtros sobre diagnóstico: seleccionan estudios de pruebas diagnósticas. Filtros sobre pronóstico: seleccionan preferentemente estudios de cohortes. Filtros sobre etiología y riesgo: seleccionan preferentemente estudios de casos y controles y de cohortes. Filtros sobre daño: seleccionan preferentemente estudios que den cuenta de efectos adversos. Filtros sobre meta-análisis: intentan seleccionar específicamente revisiones sistemáticas excluyendo revisiones de tipo narrativo. Filtros sobre evaluación económica.
80 FILTROS: Tipos “Clinical queries” Filtros preestablecidosSe ejecutan directamente Pubmed ajusta para sensibilidad o precisión Los filtros más conocidos son los “clinical queries”, que son filtros preestablecidos que pueden ser ejecutados directamente como un comando más del programa de búsqueda. Pubmed los incorpora y permite ajustarlos para sensibilidad o precisión.
81 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/clinical.html CategoryOptimized For Broad/ Narrow PubMed Equivalent therapy sensitive/broad 99%/70% (clinical[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) OR clinical trials[MeSH Terms] OR clinical trial[Publication Type] OR random*[Title/Abstract] OR random allocation[MeSH Terms] OR therapeutic use[MeSH Subheading] specific/narrow 93%/97% randomized controlled trial[Publication Type] OR (randomized[Title/Abstract] AND controlled[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) diagnosis 98%/74% sensitiv*[Title/Abstract] OR sensitivity and specificity[MeSH Terms] OR diagnos*[Title/Abstract] OR diagnosis[MeSH:noexp] OR diagnostic * [MeSH:noexp] OR diagnosis,differential[MeSH:noexp] OR diagnosis[Subheading:noexp] specific/narrow 64%/98% specificity[Title/Abstract] etiology 93%/63% risk*[Title/Abstract] OR risk*[MeSH:noexp] OR risk *[MeSH:noexp] OR cohort studies[MeSH Terms] OR group*[Text Word] 51%/95% (relative[Title/Abstract] AND risk*[Title/Abstract]) OR (relative risk[Text Word]) OR risks[Text Word] OR cohort studies[MeSH:noexp] OR (cohort[Title/Abstract] AND stud*[Title/Abstract]) prognosis 90%/80% incidence[MeSH:noexp] OR mortality[MeSH Terms] OR follow up studies[MeSH:noexp] OR prognos*[Text Word] OR predict*[Text Word] OR course*[Text Word] 52%/94% prognos*[Title/Abstract] OR (first[Title/Abstract] AND episode[Title/Abstract]) OR cohort[Title/Abstract]
82 FILTROS: Efectividad Revisión manual * Relevante (gold estándar) **No relevante Filtro de búsqueda Recuperadas a b No recuperadas c d a + c b + d S = a/(a+c) X 100 P = a/(a+b) X 100 E = d/(b+d) X 100 Se necesitan filtros que estén bien desarrollados, que funcionen y que hayan sido testados. Para evaluar la efectividad de los filtros se deben considerar una serie de parámetros: SENSIBILIDAD: proporción de registros relevantes recuperados por el filtro de búsqueda del total de registros relevantes (gold estándar) PRECISIÓN: proporción de registros relevantes recuperados por el filtro del total de registros recuperados por el filtro ESPECIFICIDAD: proporción de registros no relevantes que no son recuperados por el filtro del total de registros no relevantes. Además hay que tener en cuenta: GENERABILIDAD: la extensión a la cual los resultados del filtro de búsqueda pueden extrapolarse a la recuperación de referencias publicadas en revistas diferentes en las que el filtro fue obtenido y testado. VALIDACIÓN: confirmar los resultados del test utilizando el filtro de búsqueda en un gold estándar independiente del gold estándar utilizado para obtener el filtro de búsqueda. *Revisión manual: método utilizado para identificar los registros relevantes y no relevantes. ** Gold Standard/quasi gold estándar: conjunto de registros relevantes contra el que el resultado de la estrategia de búsqueda es testado y validado.
83 FILTROS: Checklist Objetivo Diseño Gold estándar Evaluación ValidaciónPresentación Implementación
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86 Conclusiones ¡¡¡¡Cuidado con las estrategias con terminos muy generales¡¡¡¡ Construir la pregunta Huir del lenguaje natural (cuando sea posible) Preferir siempre las búsquedas altamente especificas: Usar tesauros y descriptores Filtros metodológicos Rehacer la búsqueda siempre que sea necesario
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