1 Introducción a la Genética MédicaIntroducción general a los conceptos básicos de genética molecular: de los genes a las proteínas. 1ª Parte.
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9 1m 2nm Histona H1 11nm Histonas Nucleosoma 30nm 300nm 700nm 1400nm 9 9
10 ~2 mts.
11 Cromosomas
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14 Tamaño del genoma (MegaBases)
15 3.200 millones de bases en el genoma humanoA 1 base por segundo = 100 años para secuenciar 1 individuo
16 Tamaño del genoma (MegaBases)
17 Genómica Comparativa
18 ueotsjanslcienewnzkjdueialdmjffovpeyzrtqpañmrnivnufjkapxñsmsbcvxteuroakznagettohgpgñsksjeyqrqhdcnmvkfunxxpajarodnvolabadkaldmmnidochsueytoslapñwemdbvheteyagdsjenrbfuseowopmzsnvzfayeutogjxcmxbcvgtsteirpotlxmcndheyrisoslamdnshavjgcreutdkxmvndylplplplplplplplplplplplplpijdebvcydjendbvhxjsfnshxvjxxnmcbnxvsgetqauqpslkfmxvbxgxyswufoewpqredakjfnxzcnvxhsziuskozmvnzhdudozzjxnvkjhmxbotsjsjkdmsnbdfdhdhqdjqdmvbhpiñpiñrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjfizjfasfhanxzfsljpoiuyvaopmnvbcjxsfkhisssaoksdmxvjdfidgmnbvjhgranfgedificiotgdeljkayuntamientomxbxcvxhxksoeiotuyjfnskkajenxnkjeehgrituroqñalsjmvnxbsgqyierpspxkushsmsksjsbnnfjsfjdhxdbjfshgsajsdnncjzksksmfnxbhiueyrgjhhsgnñnosgggggrradrjyttuoutnm 18 18
19 ueotsjanslcienewnzkjdueialdmjffovpeyzrtqpañmrnivnufjkapxñsmsbcvxteuroakznagettohgpgñsksjeyqrqhdcnmvkfunxxpajarodnvolabadkaldmmnidochsueytoslapñwemdbvheteyagdsjenrbfuseowopmzsnvzfayeutogjxcmxbcvgtsteirpotlxmcndheyrisoslamdnshavjgcreutdkxmvndylplplplplplplplplplplplplpijdebvcydjendbvhxjsfnshxvjxxnmcbnxvsgetqauqpslkfmxvbxgxyswufoewpqredakjfnxzcnvxhsziuskozmvnzhdudozzjxnvkjhmxbotsjsjkdmsnbdfdhdhqdjqdmvbhpiñpiñrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjrcjfizjfasfhanxzfsljpoiuyvaopmnvbcjxsfkhisssaoksdmxvjdfidgmnbvjhgranfgedificiotgdeljkayuntamientomxbxcvxhxksoeiotuyjfnskkajenxnkjeehgrituroqñalsjmvnxbsgqyierpspxkushsmsksjsbnnfjsfjdhxdbjfshgsajsdnncjzksksmfnxbhiueyrgjhhsgnñnosgggggrradrjyttuoutnm GEN GEN 19 19
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21 Un gen está…
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23 UNA VEZ QUE DESPLIEGAS ESTAS COSAS, NUNCA VUELVEN A SER LO MISMO
24 GEN ARN PROTEÍNA
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40 DEGENERADO UNIVERSAL
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46 GENOMA 97Mb ~18.500genes 165Mb ~ genes 3.000Mb ~ genes 46
47 ATG….CCAAAATGAACGAAAATCTGTTCGCTTCATTCATTG….. Met Pro Lys Trp Thr Lys Ile Cys Ser Leu Pro Pro Gln ATPasa 8 Met Asn Glu Asn Leu Phe Ala Ser Phe Ile Ala 1 ATPasa 6 47 47
48 Genes localizados dentro de genesNF1 5’ 26 Intrón 26 (~40Kb) 27 3’ OGMP EVI2B EVI2A 5’ 3’ 48 48
49 p16 p19 Genes que comparten secuencias 3.5Kb 3.0Kb E1b 16.5Kb 3.0KbE1a E2 E3 49 49
50 Un gen varias proteínas Un gen una proteína1b 2 3 4 5 Promotores alternativos Procesamiento alternativo Sitios alternativos de poliadenilación 1a 2 3 4 5 1a 2 4 5 1a 2 3 4 5 1b 2 3 4 5 1a 3 5 1a 3 4 1a 2 3 5 50 50
51 cromátide Brazo corto (p) DNA Centrómero Brazo largo (q) Telómeros 51
52 Bandas G (Q) Bandas R Cromosoma 4 Ricas en AT Pocos genesSecuencias L1 Bandas R Ricas en CG Muchos genes Secuencias alu Cromosoma 4 52
53 Morfología de los cromosomasmetacéntrico submetacéntrico acrocéntrico 53
54 Genoma humano nuclear 3.000x106 pb / 25.000 genes exones intrones 54ATCCTGTTAGTGATTGCCGCGGATCCTACCACGGAGCAAATTCATGAGCCATGCATGAGAATGATAGCATGCATGCATGCTATATTATAGCGCAGTAGCGCATGCGACTACGGCCGATGCGATGCATGCTAGCATGCGTAGCGACTATGAGATTATATTAGCGCATTATGCGCGGGCATCGATGCAGTATGCGTATTTGCGTAGCATTATTGCGATGCTAGCTCCCTTCTCTCAGGCATGCTGATGCTCGATGCTAGCTAGCTGACTGCTAGCTGTAGCTTCTGCTAGCTACGTATCCGGTCTTCGAGATTAGGACAGGATAAACCCGATGGAGA AAAAAATTACTATCCGCGATGCTACGATGTAGCTATTTGACTAGCCCCCATGCACAAAAACTCACACCCCCACATGCATGGGGGATCGCATGCGTAGCTGCCCCATGCTAGCACTGACTTTTTTTGCAGTGCGTACAAAAACGTAGATGCGTATGCATGCTATTTAGCTATGCATTTATCGATCCGCGATGCTCTGCGCTAGCGATCGTCGTACGGGCGATCGGACGACTGCTTCTTCTCTAGACTAGCTAGCTGCGTAGCTGACTAGCGTGCTACGTAGCTACTGATATATGCTACGTATTATTAGACATGATGCAGGGGTATGATAGTGGATGGTA exones intrones 54
55 Genoma humano nuclear (<10% son genes) Gen 55
56 El DNA se puede leer en dos direcciones56 56
57 El DNA tiene 6 fases de lectura57 57
58 Gen tamaño exones Insulina 1.4 3 HLA clase I 3.5 8 Albúmina 18 14Factor VIII CFTR Distrofina 58 58
59 Genes sin intrones Genes de RNA Genes de histonasGenes de neurotransmisores Receptores de Dopamina Receptor a adrenérgico Copias autosómicas de genes del Cr. X PGK2 PDHA2 Otros IFN-a SRY Neurogenina 59 59
60 repeticiones agrupadasGenoma Humano Genoma nuclear Genes y secuencias relacionadas DNA extragénico ~25 % ~75 % copia única o poco repetido moderadamente o altamente repetitivo ~60 % ~40 % DNA codificante no codificante ~10 % ~90 % pseudogenes fragmentos génicos intrones repeticiones agrupadas o en tandem repeticiones dispersas 60
61 repeticiones agrupadasDNA extragénico ~60 % ~40 % copia única o poco repetido moderadamente o altamente repetitivo repeticiones agrupadas o en tandem repeticiones dispersas 61
62 repeticiones agrupadaso en tandem repeticiones dispersas DNA satélite DNA microsatélite DNA minisatélite LTR SINEs LINEs Tansposones 62
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75 Los seres humanos somos idénticos en un 99,9%Las diferencias (0,1%) pueden ser pequeñas variaciones de la normalidad o……. Tener consecuencias más importantes y causar enfermedades. Son las mutaciones. Las mutaciones pueden producirse a lo largo de la vida… O transmitirse de una generación a la siguiente. Las mutaciones pueden ser “dominantes” o “recesivas”
76 Mutación genética Definición Tipos más comunes Detección
77 Definición Una mutación genética es un cambio en la secuencia de nucleótidos que componen un gen. Es un cambio o variación respecto a la secuencia más común.
78 Mutaciones somáticas y germinalesSólo las mutaciones germinales pueden transmitirse a la descendencia
79 Causas de Mutación
80 Tipos más frecuentes Mutaciones puntuales silentes cambio de sentidosin sentido de procesamiento Reordenamientos de marco de lectura del/ins de un codón grandes deleciones o inserciones deleciones y duplicaciones expansión de trinucleótidos
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83 Mutation silente No cambia el aminoácido CGT - CGC
84 Mutación de cambio de sentidoEl cambio de un codón por otro ocasiona la sustitución de un aminoácido Estas mutaciones pueden afectar a la función de la proteína de forma severa, leve o en absoluto CGT AGT
85 Hemoglobina Linus Pauling, 1949Cuatro proteínas globulares, dos alfa y dos beta rodeando un grupo hemo con un átomo de Fe
86 La sustitución de una base causa la anemia falciformealelo silvestre alelo mutante fenotipo silvestre fenotipo mutante
87 Mutación sin sentido 5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’Una mutación puntual cambia un codón de un aminoácido por un codón de parada (UAA, UAG or UGA). 5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop 5’ ATG GGA GCT CTA TGA ACC TAA 3’ met gly ala leu stop
88 Mutación sin sentido Los codones de parada prematuros crean proteínas truncadas. Las proteínas truncadas no suelen ser funcionales. Algunos truncamientos tienen efectos dominantes.
89 Mutaciones de procesamientoEs una mutación que altera el patrón del procesamiento de los exones. Regla “GT/AG” Disrupción de sitios de procesamiento existentes El intrón no se elimina del RNA Creación de nuevos sitios de procesamiento de exones
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93 Mutaciones por inserción o deleciónEl código genético se lee en tripletes de nucleótidos durante la traducción. La adición o sustracción de nucleotidos que no sean múltiplos de tres modifica la pauta de lectura de la traducción. La adición o sustracción de nucleotidos que no sean múltiplos de tres añade o quita aminoácidos pero no modifica la pauta de lectura.
94 Mutación con cambio de pauta5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop 5’ ATG GGG AGC TCT ATT AAC CTA A 3’ met gly ser ser ile asn leu ….
95 Inserción o deleción de codones5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop 5’ ATG GGA TTA TTA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly leu leu ala leu leu thr stop
96 Gen de fusión Un gen se construye con segmentos de dos genes diferentes debido a recombinación desigual entre cormátidas no hermanas apareadas incorrectamente b Gg Ag d b/ d yb anti-Lepore Gg Ag d b yb Gg Ag d b yb Gg Ag d/b yb Lepore
97 Expansión trinucleótidos (mutación dinámica)Expansiones (incremento del número de repeticiones) de trinucleótidos son responsables de enfermedades hereditarias Las expansiones pueden estar: en la región promotora, en la región 5’-no traducida, en la región 3’-no traducida, en intrones, en partes exónicas codificantes.
98 Expansión de un dodecámero
99 CONSECUENCIAS DE LAS MUTACIONESPérdida de función (habitualmente recesiva) Completa Parcial Ganancia de función (habitualmente dominante) Disregulación (habitualmente recesiva) mutaciones en un promotor, intensificador, o elementos reguladores del mRNA (regiones no traducidas o uniones de sitios de procesamiento) 99
100 PROYECTO GENOMA CUANDO LE PREGUNTÉ QUE DE QUÉ ESTAN HECHAS LAS NIÑAS,PENSÉ QUE DIRÍA “DE AZÚCAR Y PIMIENTA” PROYECTO GENOMA