1 La estadística aplicada en el Programa de Investigación Epidemológica del Cáncer del Instituto Catalán de Oncología Sara Tous Belmonte Llicenciada en Ciències i Tècniques Estadístiques (Universitat Politècnica de Catalunya, 2008) Jornades de Consultoria Estadística i Software II Centre de Recerca Matemàtica, SEA, UAB 23 de Octubre de 2013 ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Càncer

2 Índice de la presentaciónInstituto Catalán de Oncología (ICO) Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer (PREC) El rol del estadístico en el PREC Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Càncer

3 Instituto Catalán de Oncología (ICO)El Instituto Catalán de Oncología (ICO) es un centro público y monográfico sobre cáncer creado en 1995 Único en todo el estado, sigue el modelo de los Comprehensive Cancer Centres que reúnen, en la misma organización, la asistencia, la prevención, la investigación y la formación especializada ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

4 Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer (PREC) (I)Objetivo: Investigación de las causas, el diagnóstico precoz y la prevención del cáncer. Jefe de programa: Francesc Xavier Bosch Líneas de investigación: Unidad de Nutrición, Ambiente y Cáncer (UNEC) y Laboratorio UNEC Jefe de unidad: Carlos Alberto González Estudios desarrollados en el marco del Estudio Prospectivo Europeo sobre Dieta, Cáncer y Salud (EPIC), coordinando, en el ámbito europeo, las líneas de: Cáncer gástrico Cáncer esofágico Exposición al tabaco Estudios de interacción de la dieta, la susceptibilidad genética e infecciones por Helicobacter pylori en la progresión de lesiones precursoras y en el origen del cáncer gástrico y del cáncer de esófago Estudios sobre la exposición a compuestos cancerígenos de la dieta, marcadores biológicos de exposición (adductos) y su interacción con genes metabólicos y su relación con el riesgo de cáncer Estudios sobre el riesgo atribuible al tabaco en la incidencia y mortalidad por cáncer en Europa y su relación con la obesidad Estudios sobre cáncer de páncreas UNIC 1.- y el origen viral de algunos tumores humanos ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

5 Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer (PREC) (II)Unidad de Infecciones y Cáncer (UNIC) y Laboratorio Duran y Reynals de Infecciones y Cáncer Jefe de unidad: Sílvia de Sanjosé Estudios sobre cáncer y Virus del Papiloma Humano (VPH): Estudios etiológicos sobre los cánceres de cérvix, vulva, vagina, ano, pene, cavidad oral, faringe y laringe Estudios sobre verrugas genitales Estudios de modelización y evaluación económicas de las medidas de prevención del cáncer de cérvix Ensayos clínicos de vacunación del VPH Coordinación del ICO Information Centre on HPV & Cancer (http://www.hpvcentre.net) Coordinación del cribado de cáncer de cérvix en la Atención Primaria de Cataluña Linfomas: Estudios sobre la etiología infecciosa de los linfomas malignos: Estudios sobre factores de riesgo infecciosos, genéticos y medioambientales Susceptibilidad genética e interacción gen-ambiente Laboratorio: Diversidad y evolución del virus del papiloma Coordinación del proyecto de formación on-line (http://www.e-oncologia.org/web/ico/presentacion) UNIC 1.- y el origen viral de algunos tumores humanos ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

6 PREC. Unidad de Infecciones y Cáncer (UNIC). EstudiosEstudios sobre cáncer genital y virus del papiloma humano (VPH). Estudios sobre la etiología infecciosa de los linfomas malignos. Estudios sobre factores de riesgo infecciosos, genéticos y mediambientales vinculados al desarrollo de linfomas. Respuesta inmune vinculada a la historia de vida laboral. Susceptibilidad genética y interacción gen-ambiente. Estudios de supervivencia en Europa de enfermedades hematológicas malignas. Respuesta inmune de las leucemias linfáticas crónicas. Estudios de infecciones por los virus de la hepatitis B y C (VHB, VHC) y riesgo de cirrosis y cánceres hepáticos. Estudios etiológicos sobre los cánceres de cérvix, de cavidad oral, de faringe, de laringe, de vagina, de vulva, de pene y de ano. Estudios de modelización y de evaluación económica de las mesuras de prevención del cáncer en España y en otros países de interés especial (hasta el momento, India, Vietnam, países de la América Latina, África y Ásia, y en 72 países que forman parte de la alianza GAVI). Estudios sobre cáncer de próstata (en preparación). ICO Information Centre on HPV & Cancer. Desarrollo de instrumentos logísticos de coordinación y de difusión de la información sobre virus y cáncer. Cribrado y prevención del cáncer cervical. Ensayos de vacunación VPH y estudios de evaluación de impacto sanitario. Estudios sobre berrugas genitales y virus del papiloma humano (VPH). ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

7 Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer (PREC) (III)Equipo humano formado por 71 profesionales Actividad 2012: 189 publicaciones en revistas internacionales 132 comunicacions en congresos 6 libros y 3 capítulos de libros editados 13 seminarios realizados 20 doctorandos Actividad: 1.- con un Factor de Impacto acumulado desde el año 2004 de 1.011,782 Aproximadamente el 50% de las publicaciones del ICO se llevan a cabo en el PREC 2.- tanto nacionales (36) como internacionales (96) Factor de impacto o Impact Factor es una medida de la importancia de una publicación científica. Cada año es calculado por el Instituto para la Información Científica (ISI o Institute for Scientific Information) para aquellas publicaciones a las que da seguimiento, las cuales son publicadas en un informe de citas llamado Journal Citation Reports. El factor de impacto tiene una influencia enorme, pero controvertida, en cuanto a la forma en que las publicaciones científicas de investigación son percibidas y evaluadas. ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

8 El rol del estadístico en el PRECImplicación global en los estudios nuevos: Solicitud de financiación Diseño del estudio Generación de formularios de recogida de datos Depuración de bases de datos Análisis e interpretación de los resultados Presentación en congresos Publicación de artículos científicos Asesoramiento estadístico y/o colaboración en estudios ya iniciados Elaboración de cursos de formación en estadística Formación contínua ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

9 El rol del estadístico en el PREC. Metodología estadística y softwareDiseño Cálculo del tamaño muestral Diseño de formularios de recogida de datos Generación y depuración de bases de datos Análisis descriptivo Tablas de contingencia Medidas de asociación Comparación de medias y proporciones Tests no paramétricos Métodos de clasificación: Co-infecciones VPH Biomarcadores Revisiones sistemáticas Software Modelos de regresión (semi)Paramétricos: Lineal/Logística/de Cox de efectos fijos Modelos de medidas repetidas (efectos aleatorios) Splines GAM Meta-análisis No-paramétricos: Bootstrap Otros Modelos de coste-efectividad Modelos de calibración de cuestionarios Análisis de interacción gen-gen / gen-huésped Ejercicios de simulación … ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

10 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC (I)Estudio Retrospectivo Internacional para la determinación de la prevalencia y distribución de genotipos de VPH en cánceres anogenitales y de cabeza y cuello (RIS HPV TT y HPV VVAPO) Muestras patológicas fijadas Variables recogidas: País de origen Año de diagnóstico Edad al diagnóstico Diagnóstico histológico Variables generadas: Información patológica Positividad por VPH Genotipación del VPH Reception and verification Re-embedding Cutting Dying Diagnosis Cutting sandwich Testing and typing ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

11 >45.000 Site of samples: Cervix Vulva Vagina Penis AnusOC/Pharynx/Larynx Site of samples: MEXICO COLOMBIA CHILE PARAGUAY PORTUGAL SPAIN CZECH REPUBLIC TURKEY KOREA.S VENEZUELA FRANCE AUSTRALIA TAIWAN GUATEMALA PHILIPPINES BANGLADESH LEBANON GREECE ALGERIA NIGERIA UGANDA MOZAMBIQUE CHINA JAPAN INDIA THAILAND USA HONDURAS PERU BRAZIL ARGENTINA NETHERLANDS CROATIA BOSNIA-HZ IT AUSTRIA POLAND KUWAIT BELARUS ECUADOR NEW ZEALAND ISRAEL GERMANY MALI SENEGAL UK URUGUAY SLOVENIA >45.000 muestras ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

12 Estudio Retrospectivo Internacional para la determinación de la prevalencia y distribución de genotipos de VPH en cánceres anogenitales y de cabeza y cuello (RIS HPV TT y HPV VVAPO) Argentina: Estela Irene Albanesi (Ministerio de Salud de la Provincia de Buenos Aires); Virginia Estrada, Sandra Erzi (Hospital San Juan de Dios); Susana Miciquevich (Facultad de Odontología de la UNLP); Australia: Gerard Vincent Wain, Catherine Jane Kennedy, Yoke-Eng Chiew (Gynaecological Oncology, Westmead Hospital); Raghwa Sharma (Department of Tissue Pathology and Diagnostic Oncology, University of Sydney and University of Western Sydney Westmead Hospital); Bangladesh: Ashrafun Nessa, AJE Nahar Rahman, Mohammed Kamal (Bangabandhu Sheikh Mujib Medical University – BSMMU); Faruk Ahmed (Dhaka Medical College Hospital); Belarus: Halina Viarheichyk, Sitnikov Valeriy (Gomel State Medical University); Achynovich Searhei (Gomel Regional Clinical Oncological Hospital); Bolivia: Pablo Sitic Vargas, Edith Claros (Insituto Oncologico del Oriente); Bosnia Herzegovina: Ermina Iljazovic (University Clinical Center Tuzla BiH); Chile: Rodrigo Prado, Carla Molina, rosa Muñoz (Centro de Oncología Preventiva, Facultad de Medicina, Universidad de Chile); Ximena Rodriguez, Marisol Guerrero,Virginia Leiva, Elsa Olave, Claudia Ramis, Viviana Toro (Hospital de San José); Colombia: Enrique Cadena, Raúl Murillo, Gustavo Adolfo Hernández Suárez, Carlos Eduardo Pinzón (Instituto Nacional de Cancerología); Manuel enrique González, Sandra Arauchan (Onmédica Investigación, Córdoba); Czech Republic: Jan Laco (Faculty Hospital Hradec Kralove); Ecuador: Leopoldo Tinoco (Hospital Oncológico Solca-Quito); Juan Carlos Ruíz Cabezas, Fernando Camacho, Rina Quinto, Leyda Jaramillo (Solca Laboratory, Guayaquil); France: Valerie Costes, Renaoud Garre, Anne Sophie Ramayl (Hospital Gui de Chauliac-Department de Pathologie); Massimo Tommasino (International Agency for Research on Cancer); Germany: Michael Pawlita, Dana Holzinger, Gordana Halec (Department Genome Changes and Carcinogenesis, Heildelberg); Falko Fend, Thorsten Biegner (Institute of Pathology,University Hospital Tuebingen); Guatemala: Hesler Morales Mérdia, Marcos Mauricio Siliezar Tala (Instituto de Cancerologia Dr. Bernardo del Valle S ); Honduras: Annabelle Ferrera (Escuela de Microbiología, Universidad Nacional Autónoma de Honduras); Flora Duarte Muñoz, Marco Molinero, Luxely Toledo, Eda Sofía Calix, Nelly Sarai Padilla (Centro de Cáncer Emma Romero Callejas, Tegucigalpa); India: Asha Jain (Cancer Prevention and Relief Society Raipur); Sushil K Giri (Regional Cancer Center, Cuttack); Maheep Bhalla (JLN Hospital & Research Center,BSP, Bhilai); Bharat Patel (Lab One Raipur); PSA Sarma (BSP Hospital); Ravi Mehrotra, Mamta Singh (M.L.N Medical College, Allahabad); Neerja Bhatla (Institute of Medical Science New Dehli); Italy: Maria Benevolo, Renato Covello, Giuseppe Spriano, Amina Vocaturo (Regina Elena Cancer Istitute); Republic of Korea: Hai-Rim Shin, Jin-Kyung Oh (National Cancer Center); Shin Gwang Kang (Asian Medical Center); Dong-chul Kim (Kangnam St. Mary's Hospital); Mali: Bakarou Kamate, Cathy Ndiaye (Hospital National DU Point G); Mexico: Isabel Alvarado-Cabrero (Instituto Mexicano del Seguro Social); Marco Antonio Duran Padilla, Patricia Alonso Viveros, Maria Esther Gutiérrez Díaz Ceballos (Hospital General de México, México DF); Rubén López-Revilla, Claudia Magaña-León (Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica, AC); Cuauhtémoc Oros (Hospital Central Ignacio Morones Prieto, San Luis Potosí); Nigeria: A.A.F. Banjo, F.B. Abdulkareem, A.O. Daramola, C.C. Anunobi, R.U. Anorlu (Lagos University Teaching Hospital Idi-Araba); Sani Malami, Ali Bala Umar (Faculty of Medicine, Bayero University); Paraguay: Elena Kasamatsu, Antonio Leoploldo Cubilla, Francisco Perrota (Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud, Universidad Nacional de Asunción); Philippines: Celia Ladines Llave, Jean Anne Toral (Cervical Cancer Prevention Center, Cancer Institute); Efren Javier Domingo, Jericho Thaddeus P. Luna, Maria Julieta V. Germar, Arnold M. Fernandez, Carolyn Zalameda Castro, Roslyn Balacuit (University of the Philippine College of Medicine General Hospital); Poland: Tomasz Szafaroswski (Czerniakowski Hospital); Portugal: Ana Felix, Jorge Manuel Soares (Instituto Portugues de Oncologia de Lisboa Francisco Gentil); Senegal: Cathy Ndiaye, Nafissatou Ndiaye Ba, Victorino Mendes (HOGGY stands for Hôpital Général de Grand Yoff ; DANTEC - Hôpital A. Le Dantec; FAC - Faculté de Médecine - Université Cheikh A. Diop); Slovenia: Mario Poljak, Boštjan J. Kocjan, Nina Gale, Polona J. Maver (Institute of Microbiology and Immunology, Ljubljana); Spain: Belén Lloveras, Gemma Martín (hospital del Mar); Llúcia Alós (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona); Julio Velasco Alonso, Cristina Pérez (Hospital San Agustín); Maria Alejo (Hospital General de l’Hospitalet); Xavier Leon, Miquel Quer (Hospital de Sant Pau); Marcial García Rojo, Lucía González López, Matías cuesta Gil (Hospital General Universitario de Ciudad Real); Laia Alemany, Francesc Xavier Bosch, Ignacio G. Bravo, Vanesa Camón, Xavier Castellsagué, Omar Clavero, Silvia de Sanjosé, Anna Esteban, José M. Godínez, Yolanda Florencia, Joellen Klaustermeier, Marisa Mena, Nubia Muñoz, Beatriz Quirós, Cristina Rajo, Sara Tous, Marleny Vergara (Institut Català d’Oncologia); The Netherlands: Wim G.V. Quint, Anco C. Molijn, Daan T. Geraets, Núria Guimerà (DDL Diagnostic Laboratory); Chris J.L.M Meijer (Vrije Universiteit Medical Center); Turkey: Ruacan Arzu (Hacettepe University); UK: Henry Kitchener (School of Medicine, University of Manchester); Robyn Davies, Godfrey Wilson (Manchester Royal Infirmary); Mehanna Hisham, Davy Rapozo, Whitmore Shelley, James Sean (UHCW NHS Trust); USA: Marc Wendy Cozen, Marc T. Goodman, Brenda Y. Hernández, Charles Lynch, Daniel B. Olson, Freda R. Selk (Cancer Center, Hawaii-Iowa); Edyta C. Pirog (New York Hospital - Cornell Medical Centre); Venezuela: Pablo Dabed (Universidad Central de Venezuela) >30 Países >50 Centros >150 Investigatores Updated: September, 2013 ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

13 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC (I)Estudio Retrospectivo Internacional para la determinación de la prevalencia y distribución de genotipos de VPH en cánceres anogenitales y de cabeza y cuello (RIS HPV TT y HPV VVAPO) Creación de formularios de recogida de datos Coordinación del procesamiento de las muestras Análisis de los controles de calidad entre laboratorios Modelos de regresión logística Estimación de la contribución relativa de los genotipos de VPH según región geográfica, año de diagnóstico, edad de diagnóstico e histología del cáncer Cervix Vulva Vagina Penis Anus OC/Pharynx/Larynx Site of samples: Samples received*: Cervix- 15,792 Penis- 1,194 Vagina- 780 Vulva- 2,543 OC/Pharynx/Larynx- 2,114 Anus- 726 MEXICO COLOMBIA CHILE PARAGUAY PORTUGAL SPAIN CZECH REPUBLIC TURKEY KOREA.S VENEZUELA FRANCE AUSTRALIA TAIWAN GUATEMALA PHILIPPINES BANGLADESH LEBANON GREECE ALGERIA NIGERIA UGANDA MOZAMBIQUE CHINA JAPAN INDIA THAILAND USA HONDURAS PERU BRAZIL ARGENTINA NETHERLANDS CROATIA BOSNIA-HZ IT AUSTRIA POLAND KUWAIT BELARUS ECUADOR NEW ZEALAND ISRAEL [*Samples received: include invasive cancer cases, pre-neoplasic lesions and controls] Updated: April, 2011 GERMANY MALI SENEGAL UK URUGUAY SLOVENIA HPV type distribution in 10,575 cervical cancer cases 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 +68 or 73 +59 +51 +39 +58 +35 +52 +33 +31 +45 +18 16 % 61.1% 9.3% 5.5% 4.5% 4.3% 2.5% 2.0% 1.8% 1.5% 1.2% 1.1% Metodología: formularios (información de los centros colaboradores, de anatomía patológica, de los laboratorios) ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

14 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC (II)Estudio Retrospectivo Internacional para la determinación de la prevalencia y distribución de genotipos de VPH en cánceres anogenitales y de cabeza y cuello (RIS HPV TT y HPV VVAPO) Imputación de missings: STATA command: impute depvar indepvars [if] [in] [weight] , generate(newvar1) [options] Métodos de clasificación: GNU R & IGRAPH (http://www.r-project.org/) Modelos de efectos aleatorios: para el estudio de las co-infecciones por VPH STATA command: xtmepoisson depvar [fe_equation] || re_equation [|| re_equation ...] [, options] Producción científica: 23 artículos publicados. A destacar: de Sanjosé et al. Lancet Oncology 2010 (cérvix) de Sanjosé et al. European Journal of Cancer 2013 (vulva) 11 artículos en preparación. ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

15 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC (II)Estudios de comparación de diferentes técnicas de determinación clínica del VPH Metodología estadística: Generación del formularios de recogida de datos Análisis descriptivo Tablas de contingencia Medidas de asociación (concordancia, sensibilidad, especificidad, VPP, VPN) Producción científica: Pérez C et al Diagnostic molecular Pathology 2012 Godínez JM et al. Infectious Agents and Cancer 2011 Godinez J et al. (en preparación) ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

16 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC (III)Estudio prospectivo de recurrencia/recidiva sobre una cohorte de mujeres con lesiones cervicales de alto grado tratadas con una conización Metodología estadística: Modelos de regresión logística Análisis de supervivencia y Regresión de Cox Producción científica Fernández MA et al. (en preparación) Estudio Prospectivo de pacientes con cáncer de Orofaringe (fase de reclutamiento) Estudio retrospectivo de una población australiana con verrugas genitales (N 700) Estimación de la contribución relativa de los genotipos de VPH Análisis de correspondencias Producción científica: Pimenoff VN et al. (en preparación) ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

17 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC (IV)Formación 10 cursos en el ámbito de la estadística 12 cursos relacionados con la actividad profesional Presentaciones congresos 32 internacionales 4 nacionales Publicaciones: 15 revistas científicas internacionales 1 revista científica nacional ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

18 Mi experiencia de 8 años en el PREC/UNIC. ConclusionesImplicación global en los proyectos Conocimiento exhaustivo de los temas de investigación Relación estrecha con los investigadores Posibilidad de reflexión sobre los análisis a realizar Promoción laboral Financiación (becas, cursos, congresos, …) ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

19 Agradecimientos PREC Xavier, Silvia, Xavi Laia Alemany y Bea QuirósMireia Díaz Equipo Tumores viejos Yolanda Benavente Ramón Clèries Esther Roura Servei Estadística de l’Autònoma ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

20 ¡MUCHAS GRACIAS! ¿Preguntas? http://ico.gencat.cat ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

21 BACK UP SLIDES ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

22 PROGRAMA DE INVESTIGACIÓN EN EPIDEMIOLOGÍA DEL CÁNCERMaria Alejo Médico patólogo Omar Clavero LABORATORIO INFECCIONES & CANCER Vanesa Camón T. Sup. Anatomía patológica Ana Esteban Grado Biomedicina Yolanda Florencia T. Sup.Anatomía Mercè Peris Médico preventivista Marleny Vergara Lic. Biología Ignacio G. Bravo Respons. Lab. Infec&Cancer JE Klaustermeier T. Sup. Laboratorio Ville Pimenoff Doctor Medicina molecular y genética poblacional Stephanie Bedhome Doctora Biología y ecología evolutiva Marta Félez Invest. Predoc José M. Godínez Dpctor Biología Beatriz Mengual Sara Nicolás Cristina Oliveira Invest. Prostdoc Esther Roura Lic. Estadística Leonidas Georgalis Máster Salud Públiica Mireia Díaz Yolanda Benavente Ginesa Albero T. Sup. Estadistica Sara Tous Raquel Ibañez Laia Alemany Médico preventivista Claudia Robles Lic.Farmacia Laia Bruni Médico preventivista. Beatriz Quirós Diplom. Estadística Delphine Casabonne Doctora Epidemiología Vanesa Rodriguez Lic. Fisioterapia Laura Costas Maria Brotons Marisa Mena Doctora Ciencias Biomédicas Leslie Barrionuevo Paloma Quesada Lic. Bióloga Yasmin Sabate Lic. Psicología Bea Serrano Gisela Álvarez Llic. Psicología Nuria Sala Facultativa Coord. Lab de Rec. Transl. Doctora Francesc Xavier Bosch Jefe de Programa Doctor medicina Sílvia de Sanjosé Jefe de Unidad Doctor en Higiene y Medicina tropical Xavier Castellsagué Jefe Clínico Doctor Epidemiología y Salud Pública Carlos A. González Antonio Agudo Adjunto Eric Duell Adjunto Epidemiólogo Doctor Genevieve Buckland Raul Zamora Paula Jakszyn Leila Luján Catalina Bonet Nadia García T. Laboratorio Osmel Companioni Mireia Obon Nutricionista Ana Fonseca Elisa Muñoz Estadística Andreu Pi Informático UNEC Adoración Venceslá Noemie Travier P R E C PROGRAMA DE INVESTIGACIÓN EN EPIDEMIOLOGÍA DEL CÁNCER U N I C UNIDAD DE INFECCIONES Y CÁNCER U N E C UNIDAD DE NUTRICIÓN, AMBIENTE Y CÁNCER X Personal contrado IDIBELL/CIBERESP LEYENDA: ICO Personal estructural con plaza (subrallado implica personal a cargo) ICO Personal estructural pendiente de convocatoria Otras situaciones (Comission servicios, subcontractacion, etc.) ICO Personal contractat Responsabillidad / coordinación funcional Francesc Alarcón T. InformÁtico GESTIÓN / PM TICS INFORMÀTICA Jesus Muñoz Coord. T. Sup. Infórmática Nati Patón Adm. (UNIC) Cris Rajo Responsable GestióN Angela Expósito Administratiu (UNEC) Assumpta Company Fac. Comiss. Serv. Olga Guillén T. pedagogía DIFUSIÓN E-ONCOLOGIA Raquel Cosano T. Telecomunicacions Ana Sedano Resp. Univ. Corp Ion Espuña Aux. Adm. (UNIC) Mireia Montserrat Aux. Adm. Patricia Pérez Adrià Kogevinas ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

23 Papers RIS HPV TT & HPV VVAPOCervix. Publicados: De Sanjosé et al. Human papillomavirus genotype attribution in invasive cervical cancer: a retrospective cross-sectional worldwide study. Lancet Oncol Nov;11(11): Odida et al. Human Papillomavirus type distribution in invasive cervical cancer in Uganda. BMC Infect Dis Jun 24;8:85 Odida M et al. Comparison of human papillomavirus detection between freshly frozen tissue and paraffin embedded tissue of invasive cervical cancer. Infect Agent Cancer Sep 16;5:15 Usubütün A et al. Human papillomavirus types in invasive cervical cancer specimens from Turkey. Int J Gynecol Pathol Nov;28(6):541-8 Mariani L et al. Human papillomavirus prevalence and type-specific relative contribution in invasive cervical cancer specimens from Italy. BMC Cancer Jun 4;10:259 Oh JK et al. Type-specific Human Papillomavirus Distribution in Invasive Cervical Cancer in Korea, Asian Pacific J Cancer Prev, 11, Alemany L et al. Human papillomavirus genotype distribution in cervical cancer cases in Spain. Implications for prevention. Gynecol Oncol Mar;124(3):512-7 Pérez C et al. Comparison of 2 different PCR-based technologies for the detection of human papilloma virus from paraffin-embedded tissue: genómica clinical arrays versus SPF(10)-LiPA(25). Diagn Mol Pathol Mar;21(1):45-52 Ndiaye C et al. Human papillomavirus distribution in invasive cervical carcinoma in sub-Saharan Africa: could HIV explain the differences? Trop Med Int Health Oct 29 Kasamatsu E et al. Type-specific human papillomavirus distribution in invasive cervical carcinomas in Paraguay. A study of 432 cases. J Med Virol Oct;84(10): Geraets D et al. Detection of rare and possibly carcinogenic human papillomavirus genotypes as single infections in invasive cervical cancer. J Pathol Jun 19 Serrano B et al. Potential impact of a nine-valent vaccine in human papillomavirus related cervical disease. Infect Agent Cancer Dec 29;7(1):38 Sanchez GI et al. Clinical evaluation of polymerase chain reaction reverse hybridization assay for detection and identification of human papillomavirus type 16 variants. J Clin Virol Jul;51(3):165-9 Godínez JM et al. Differential presence of Papillomavirus variants in cervical cancer: an analysis for HPV33, HPV45 and HPV58. Infect Genet Evol Jan;13:96-104 Guimerà N et al. The Occasional Role of Low-risk Human Papillomaviruses 6, 11, 42, 44, and 70 in Anogenital Carcinoma Defined by Laser Capture Microdissection/PCR Methodology: Results From a Global Study. Am J Surg Pathol Sep;37(9): Guimerà N et al. Laser capture microdissection shows HPV11 as both a causal and a coincidental infection in cervical cancer specimens with multiple HPV types. Histopathology Aug;63(2):287-92 De Sanjosé et al. Age-specific occurrence of HPV16- and HPV18-related cervical cancer. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev Jul;22(7): ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer

24 Papers Cervix. En preparación: Alemany L et al. Time trends of Human Papillomavirus types in invasive cervical cancer, from 1940 to 2009 Félix A et al. HPV distribution in invasive cervical cancer in Portugal Iljazovic E et al. Human Papillomavirus genotype distribution in invasive cervical cancer in Bosnia and Herzegovina Sanchez GI et al. Secular trends of HPV genotypes in invasive cervical cancer in Colombia Serrano B et al. Burden of HPVs 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52, and 58 in invasive cervical cancers and precancerous lesions in four emerging countries: Brazil, Mexico, China and India Pirog K et al. Review of adenocarcinoma cases in the RIS HPV TT study Alejo M et al. Human papillomavirus in neuroendocrine tumors of the cervix. A relevant role for HPV 18. Nigeria Guimerà N. Variants in HPV16 & HPV18 in adenocarcinoma Vulva. Publicados: de Sanjosé et al Worldwide human papillomavirus genotype attribution in over 2000 cases of intraepithelial and invasive lesions of the vulva. Eur J Cancer Nov;49(16): Ordi J et al. HPV-negative vulvar intraepithelial neoplasia (VIN) with basaloid histologic pattern: an unrecognized variant of simplex (differentiated) VIN.. Am J Surg Pathol Nov;33(11): Vulva. En preparación: Ordi et al. VIN con biomarcadores Vagina. En preparación: Saunier M et al. HPV genotype distribution in vaginal cancers worldwide Ano. En preparación: Alemany L et al. HPV genotype distribution in anal cancer worldwide Penis. Publicados: Cubilla AL et al. Basaloid squamous cell carcinoma of the penis with papillary features: a clinicopathologic study of 12 cases. Am J Surg Pathol Jun;36(6):869-75 Cubilla AL et al. Value of p16(INK)⁴(a) in the pathology of invasive penile squamous cell carcinomas: A report of 202 cases. Am J Surg Pathol Feb;35(2):253-61 Cubilla AL et al. The basaloid cell is the best tissue marker for human papillomavirus in invasive penile squamous cell carcinoma: a study of 202 cases from Paraguay. Am J Surg Pathol Jan;34(1):104-14 Penis. En prepàración: Alemany L. Worldwide in penile cancer H&N. Publicados: Ndiaye C et al. The role of human papillomavirus in head and neck cancer in Senegal Infect Agent Cancer Apr 17;8(1):14 ICO L’Hospitalet. Programa de Investigación Epidemiológica del Cáncer