1 Museo Nacional de Ciencias Naturales-CSIC II Jornadas de SIG Libre Pere Roca Ristol Pablo Sastre Jorge Miguel Lobo Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

2 EDIT: European Distributed Institute of Taxonomy Red de Excelencia financiada por la UE. CSIC con cuatro centros: -Museo Nacional Ciencias Naturales (MNCN) -Real Jardín Botánico (RJB) -Centro de Estudios Avanzados de Blanes (CEAB) -Instituto de Ciencias del Mar Unir esfuerzos en la investigación y conocimineto taxonómico contribuyendo de forma substancial en el conocimiento global de la biodiversidad Desarrollo del paquete de trabajo 5.4 (Geo-herramientas)

3 Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT Taxonomia: clasificación de los seres vivos en grupos Categorías taxonómicas: especie, género, familia, orden, clase, tipo y reino... y muchas más !

4 El árbol de la clasificación biológica canvia diariamente! - nuevas especies - canvio de nombres establecidos y se modifica la clasificación: Enmienda de errores de procedimiento Diferencias conceptuales entre taxónomos son extremadamente comunes, lo cual lleva a una gran inestabilidad potencial en los nombres de los taxones. El avance de la ciencia hace inevitable estas alteraciones; el nuevo conocimiento obliga a modificar Sinonimias Solución propuesta: dar a conocer la información -posibilidad descubrimiento y enmienda errores por parte de otros investigadores -damos acceso al público en general -con datos las posibilidades de investigación se multiplican -mejora de la gestión y protección de la naturaleza Error temático + error georeferenciación Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

5 GBIF : Global Biodiversity Information Facility colecciones de historia natural bancos de semillas herbarios centros de investigación ( info georeferenciada o susceptible de serlo! ) Digitalización Ejemplares de invertebrados en distintos centros

6 Reino Animalia (58 millones registros georeferenciados) Reino Plantae (28 millones de registros georeferenciados) Mucha información... pero con ciertos errores! Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT GBIF Se han propuesto llegar a 1 billón de registros!!

7 Disponer de tantos datos invita a usarlos, pero...jugamos o hacemos ciencia? Modelizar es peligroso... aún más con baja calidad de datos! Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

8 Urge disponer de herramientas de fácil uso para evaluar la calidad de los datos. Se priorizan los datos propios (no remotos como GBIF) Calidad de datos: - a nivel puntual (registro a registro) -a nivel de inventario -mis recolectas han sido lo suficientemente exhaustivas como para poder aplicar métodos de modelización? -en qué zonas deberia centrar mis futuras campañas de colecta? Importar, visualizar, filtrar y realizar análisis geo-estadísticos sobre mis datos (pre-análisis) Análisis elementales: -numero registros por unidad territorial -numero géneros por unidad territorial -relación géneros/registros Más complicados -fiabilidad de los inventarios Orientados a medir la fiabilidad o completitud de los datos. pueden ser de gran utilidad para taxónomos inexpertos (o no) en GIS Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

9 numero registros por unidad territorial (cuánto esfuerzo de muestreo hemos dedicado a cada unidad territorial?) Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT Barcelona

10 numero géneros por unidad territorial (cuánta “biodiversidad” hemos encontrado en cada unidad territorial?) -relación géneros/registros Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT Es lógico que donde más hemos buscado más diversidad encontremos... hay que hacer una proporción

11 Incertidumbre del inventario (I): Num Genera / Num registros Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT En qué unidades territoriales la posibilidad de encontrar nuevas especies es mayor? Pocos géneros... pero en zona muy poco muestrada! Si le dedicásemos más esfuerzo, tenemos altas posibilidades de detectar nuevas especies Seguramente no aportará nada de nuevo

12 Incertidumbre del inventario (II): esfuerzo medio dedicado a descubrir la última especie encontrada en cada unidad territorial Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT Curvas de acumulación Número de registros Número especies Alta pendiente al final de la curva. Si siguiéramos muestreando encontraríamos nuevas especies Mal inventario (incompleto) Baja pendiente Aunque aumentemos las observaciones no encontramos nuevas especies La unidad territorial está biológicamente exhausta Buen inventario

13 Incertidumbre del inventario (II) Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

14 Cálculo de la variabilidad ambiental o de la representatividad ambiental de los puntos del usuario Asignación de valores a cada celda o píxel en función del número de puntos que se sitúan en lugares con características ambientales similares: siguen mis puntos un patrón ambiental? Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT Esfuerzo de muestreo (número de registros) sobre ráster precipitación anual Web Processing Service como solución?

15 Implican desarrollo de: -base de datos con análisis espacial: PostGIS -visualizador web: mapBuilder (javascript, XML, XLST,DOM, Ajax) -servidor mapas: GeoServer -desarrollo herramientas de apoyo: jQuery (libreria javascript) -tecnologia servidor: PHP en Apache; Tomcat (GeoServer y MapBuilder) Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT php MapBuilder + jQuery Apache PostGIS (puntos y poligonos) Tomcat Peticiones WMS Generación dinámica de SLD

16 Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT Análisis punto-en-polígono “mi SLD” Geoserver

17 Desarrollo de complementos con JQuery -ligero (20 Kb)con sintaxis senzilla -fácil manipulación del DOM -eventos espectaculares -Ajax fácil: getJSON, getScript, interactuación con PHP (GET, POST),incrustando los resultados en HTML o reutilizándolos como nuevos parámetros -plug-ins usados: JqModal: generación de ventanas móviles farbtastic: selección de colores -acceso remoto a capas WMS (presentes en la colección de WMS-sites.com) Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

18 Y además... múltiples capas para descargar en diferentes formatos (idrisi, shape, ascii...) http://edit.csic.es http://edit.csic.es/edit_geo/prototype/edit.html Otros retos: Web Feature Service-Transaccional -definición por parte del usuario del área de estudio (ej: zona transalpina) -manipulación datos previamente insertados y correr de nuevo análisis Recolecta, visualización y análisis de bases de datos remotas (GBIF) Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT

19 Preguntas ? Pere Roca Ristol [email protected] Desarrollo de una aplicación web dentro de la Geoplataforma Cibertaxonómica Europea EDIT