SiguienteAnterior Bases de Datos de Imágenes en Internet de Anatomía Patológica Mesa Redonda del Club de Informática Aplicada de la Sociedad Española.

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Author: Pedro Sandoval Álvarez
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2 SiguienteAnterior Bases de Datos de Imágenes en Internet de Anatomía Patológica Mesa Redonda del Club de Informática Aplicada de la Sociedad Española de Anatomía Patológica. Dr. E. Moro XIX Congreso Nacional de la SEAP Barcelona, Septiembre 18; 1999 Dr. R. Duran

3 SiguienteAnterior Bases de Datos de Imágenes de Anatomía Patológica en Internet Introducción Tecnología en BD-M Proyectos a seguir Selección de Recursos Nuestra experiencia: eusalud-l Perspectiva y Horizonte Conclusiones y propuestas

4 SiguienteAnteriorIntroducción La anatomía patológica especialidad eminentemente morfológica. Las imágenes m.o./m.e. son nuestras herramientas de trabajo diarias. Las nuevas tecnologías emergentes de transmisión de imágenes como medio inigualable de comunicación entre patólogos.

5 SiguienteAnteriorIntroducción XIX Congreso SEAP

6 SiguienteAnteriorIntroducción Un servidor de bases de datos debe poder realizar: –Búsquedas en la base de datos en función a criterios. –Recoger, ordenar y formatear datos. –Añadir, modificar y borrar casos. –Crear nuevas bases de datos o estructuras de información. –Mantener una absoluta integridad. –Ejecutar ciertos procedimientos mediante código programado o establecer cierta comunicación entre los clientes. –Tener un alto nivel de seguridad. XIX Congreso SEAP David R. Vidal Pc World, Marzo 1999

7 SiguienteAnterior Tecnología en Bases de Datos IBM DB2 5.2 (IBM Corp.) Informix Dynamic Server 7.2 - Fundation 2000 (Informix) InterBase 5.5 (InterBase Sof. Corp.) MS SQL Server 7 (Microsoft Corp.) Oracle 8i (Oracle Corp) Sybase Adaptive Server 11.5 (SyBase Corp.) Microsoft Access (Microsoft Corp.) FileMaker Pro 4.1 (Claris Corp.) * ADABAS (Sotware AG)

8 SiguienteAnterior Tecnología en Bases de Datos La mayor parte de las bases de datos actuales permiten conexiones a través de ODBC, JDBC, Perls e incluso a través de librerías propias para enlazar con lenguajes como C o C++ Cada vez es más frecuente poder publicar o consular bases de datos en la World Wide Web utilizando un servidor web incorporado y acceso TCP/IP a Internet, bien usando páginas activas de servidor (ASP) o gracias un lenguaje de marca dinámico (por ejemplo como el que usa FileMaker Pro con su CDML lenguaje de marca dinámico de Claris)

9 SiguienteAnterior Selección de Recursos Health on the Net (HON) Medical Images & Movies The JayDoc HistoWeb (Millón Wolf, Marc Scarbrough) Histopathology Images The Urbana Atlas of Pathology University of Pittsburgh - Case of the month WebPath - Organ System Pathology Images The Telepathology Archive - AFIP Tumorboard Atlas of Liver Pathology - University Iowa Dermatology Image Bank Atlas Interactivo de Urología XIX Congreso SEAP

10 SiguienteAnterior Selección de Recursos On-line Atlas of Derrmatology and Rheumatology Hematology Image Atlas Atlas of Hematology Nagoya University School of Medicine 6º Curso de Hematopatología - Tortosa Public Health Image Library, CDC, Atlanta, GA Atlas of Medical Parasitology Pathconsult -- Case Report RDB BioImage Date Base Casos Clínico-Patológicos - Anatomía Patológica de Orense Comunidad Virtual de Anatomía Patológica

11 SiguienteAnterior Selección de Recursos Características Técnicas: (A) Web Sites de Patología con páginas estáticas editadas en HTML (B) Web Sites con páginas asociadas a Bases de Datos mediante ASP (páginas activas de servidor) (C) JDBC con conexión a Bases de Datos dentro de una arquitectura cliente/servidor usando tantao apps como applet de desarrollo propio l en enlace simula un app Haga clic en cada página lJDBC con conexión a Bases de Datos dentro de una arquitectura cliente/servidor usando tantao apps como applet de desarrollo propio Tipos de Accesos (A) Público y sin restricciones (B) Restringido bajo login y password

12 SiguienteAnterior Proyectos a seguir The AFIP Department of Telemedicine MISSION The AFIP Department of Telemedicine supports and enhances the missions and strategic goals of the Armed Forces Institute of Pathology by evaluation and distributed deployment of emerging telecommunications technology within the Institute environment. In this fashion, the Department of Telemedicine maximizes the cost-effectiveness, speed of delivery, and quality of health care services and educational opportunities provided by AFIP personnel, and serves as a fertile testbed for new and innovative usage of emerging technology. XIX Congreso SEAP Bruce Williams, DVM Chairperson HM1 Daniel R. Butler, H.T. (ASCP) Systems Administrator Rod Herring, Tech Support Services Specailist Scott Graf, AFIP Webmaster

13 SiguienteAnterior Proyectos a seguir EUROPATH PROJECT European Pathology Assisted by Telematics for Health OBJECTIVES: –Integration of multimedia telecom. tools between pathologists to improve: Quality assurance; Diagnostic accuracy; Cost efficiency –Implementation of multimedia European databases for: Pathology Case reports and jurisprudence; Reference Macro- and Microscopical Images; Markers provided by Cytometry, Cytogenetics and Biochemistry –Design of inter-operability standards and « good practice » guidelines for: Remote consultation; Remotely driven microscopy; Consensus tele- conferences Pr. Gérar Brugal, Project Manager Supported by the Commission of the European Union (DGXIII : Telematics for Health)

14 SiguienteAnterior Nuestra experiencia: eusalud-l EU_SALUD Nace en 1995 como echoarea de Euronet con tecnología fidonet Prácticamente en desuso desde octubre de 1997 eusalud.htm (1996) Nace una página en www.geocities.com Se mantuvieron los objetivos del área Euronet Se construyen páginas de enlaces y los primeros casos clínicos-patológicos XIX Congreso SEAP

15 SiguienteAnterior Nuestra experiencia: eusalud-l ~eusalud2/ (1997) Contenidos: Caso del mes; Documentos casos: Monográficos Lista de correo; Calendario; Otros recursos; ASION; Control de Acceso; Bolsa de Trabajo; Buzón de Imágenes médicas. http://www.eusalud.net - eusalud-l RedIris (1998 - 1999) Foro de Discusión de Casos Clínicos Basados en Imágenes Biomédicas - 46 Casos presentados; 12 Mongráficos Se han distibuido 129 msjs. Media de 120 suscriptores http://eusalud.uninet.edu (2000...) Potenciaremos el uso de una base de datos de imágenes médicas Introduciremos en nuestras páginas XML -- PhtML ?

16 SiguienteAnterior Nuestra experiencia: eusalud-l Estadísticas NedStat para Bolsa de Trabajo de Eusalud Estadísticas desde el 30 de julio de 1998, 21:24 Generada a las 17:44, el 14 de septiembre de 1999 Total de visitas reales desde el inicio: 1817 Día más ocupado: 4 de marzo 1999 con 16 visitas reales Estadísticas NedStat para Caso del Mes Estadísticas desde el 1 de septiembre de 1997, 22:11 Generada a las 17:44, el 14 de septiembre de 1999 Total de visitas reales desde el inicio: 1416 / 4075 hits Día más ocupado: 8 de noviembre 1997 con 11 visitas reales

17 SiguienteAnterior Nuestra experiencia: eusalud-l - 409 Imágenes correspondientes a 115 casos diferentes - 25 Autores diferentes en eusalud-l - 1356 Imágenes -- repositorio de 891 casos de tumorboard - 73 Autores diferentes de tumorboard Veamos en la práctica como funciona una base de datos de imágenes

18 SiguienteAnterior Perspectiva y Horizonte XIX Congreso SEAP Crecimiento del número de Servidores www de junio 1993 a junio 1999 y escala logarítmica y exponencial del número de Sitios con una proyección en el año 2.000

19 SiguienteAnterior Perspectiva y Horizonte XIX Congreso SEAP

20 SiguienteAnterior Perspectiva y Horizonte

21 SiguienteAnteriorConclusiones Durante la década de los 90 hemos sido testigos del nacimiento y espectacular desarrollo de Internet. La Patología no se ha quedado al margen. Liderada por los Webs americanos, está teniendo un verdadero alcance global tanto en el terreno de la formación como en el de la comunicación. Predominan las páginas estáticas html sobre asp entre los Recursos relacionados con Atlas, Repositorios de Casos, Bases de Datos de Imágenes, Casos del mes etc. Los recursos basados en Bases de Datos accesible a través de Internet resultan un avance, en cuanto sistema de consulta, si bien pueden ser ¨impermeables¨ a los buscadores globales.

22 SiguienteAnterior Propuesta al ClIA-SEAP Dear Marcial, President of INABIS 2000. I would like to organize a Symposium on ¨Proposals for a new XML - PthML (Pathology Extensible Markup Language) in Pathology Sites¨. The Symposium should be help to reach a consensus between all the people working on the same field that publishs Pathology documents on the net and would like to use a new specific specialized XML. Best regards J. Ernesto Moro M.D. mailto:[email protected] XIX Congreso SEAP

23 SiguienteAnterior Documentos relacionados Haga clic para el Abstract Haga clic para Addendum Lanzar preguntas

24 SiguienteAnterior Agradecimiento -- Colaboradores - Dr. Luis Alfaro - Dr. Mariano Alvira - Dr. Ramón Duran Merino - Dr. Manuel Lecona Echevarría - Dr. Antonio Maldonado - Dr. Manuel Medina Pérez - Dr. Angel Montesinos Fernández - Dra. Carmen Parra - Dra. Inmaculada de Prada Vicente - Dr. Matías Jimenez Ayala - Dr. José Sanchis Cervera - Dr. Carlos Santos Durán - Dr. José Miguel Sanz Anguela - Dr. Alberto del Valle Manteca

25 SiguienteAnteriorReferencias - M. García Rojo. Digitalización de Imágenes en Anatomía Patológica. Informática y Salud, Noviembre 1997 Nº13; 638-641 - L. Alfaro, M.J. Roca, E. Poblet, A. Froufe, M. Rayón. Telepatología en Internet: optimización de la transmisión de imágenes con líneas de telefonía convencional. Rev Esp Patol 1998; 31(2):121-126 - Guía de Internet de Diario Médico. Recoletos Compañía Editorial, S.A. 1998, Madrid. - M. García Rojo. Webs de interés en Medicina. Informática y Salud, Enero/Febrero 1998 Nº14; 710-712 - Hobbes' Internet Timeline v4.2 http://www.isoc.org/guest/zakon/Internet/History/HIT.htmlhttp://www.isoc.org/guest/zakon/Internet/History/HIT.html - J.M. Framiñan Torres, J.M. León Blanco. Gestión de Bases de datos en Internet: JDBC Vía Internet. Ediciones Anaya Multimedia, S.A., 1998. Madrid - D.R. Vidal. Servidores de Bases de Datos. PC World, Marzo 1999; 209-231 - P. Mingo. Bases de Datos Relacionales para Linux. PC World, Octubre 1998; 228-239 - E. Trigos. Curso de páginas ASP. PC World, Marzo a Junio 1999; I:277-283, II:303-312; III:259-266, y IV:317-327 - N. Pitts. XML. Temas Profesionales. Ediciones Anaya Multimedia, S.A., 1999. Madrid - M.T. Morales, J. Arrieta, C.H. Salvador. Implementación de un conversor SGML-ODA (ISO/ 8897 - 8613) de documentos médicos multimedia. Informática y Salud, Mayo/Junio 1998 Nº16; 803-807

26 SiguienteAnteriorReferencias - F. Martín Sánchez, Bioinformática, Genética y Salud. Informática y Salud, Septiembre/ Octubre, 1998 Nº22; 803-807 - O. González. Universal Date Access y OLE DB. Byte, 7-8/99 Nº 53; 120-125 - A. Medina, Crespo del Coro, Fernández González, Maojo García, Martín Sánchez, Pazos Sierra, Sáez Ayerra, Sanandrés Ledesma. Búsqueda, acceso y recuperación de información sanitaria en bases de datos a través de www. Informática y Salud, Marzo 1999 Nº20; 1032-1033 - US biologist proporse launch of electronic preprint archive. Nature (397,91;1999) - NIH plan brings global electronic journal a step nearer reality. Nature (398, 735;1999) - H. Varmus, D. Lipman, P. Brown. E-BIOMED: A Proposal for Electronic Publications in the Biomedical Sciences http://www.nih.gov/welcome/director/ebiomed/ebiomed.htmhttp://www.nih.gov/welcome/director/ebiomed/ebiomed.htm - Mixed response to NIH´s web journal plan. Nature (399, 8;1999) - Europe´s molecular biologists could join global e-journal plan. Nature (399, 292;1999) - Varmun defends plan for global biomedical e-jorunal. Nature (399, 720;1999) - EMBO backs single electronic repository. Nature (400, 97;1999) - Critics query financing of proposal ´E-Biomer´. Nature (400, 200;1999) - Asia backs E-Biomed ´with peer review´. Nature (400, 491;1999) - E-Biomed to be launched as a repository for research. Nature (401, 6;1999)

27 SiguienteAnterior Lista de Recursos y sus URL - Health on the Net (HON) Medical Images & Movies http://www.hon.ch/Media/anatomy.html http://www.hon.ch/Media/anatomy.html - The JayDoc HistoWeb (Millón Wolf, Marc Scarbrough) http://www.kumc.edu/instruction/medicine/anatomy/histoweb/index.htm http://www.kumc.edu/instruction/medicine/anatomy/histoweb/index.htm - Histopathology Images http://ike.engr.washington.edu/software/eduimg/histop.html http://ike.engr.washington.edu/software/eduimg/histop.html - The Urbana Atlas of Pathology http://www.med.uiuc.edu/PathAtlasf/titlePage.html http://www.med.uiuc.edu/PathAtlasf/titlePage.html - University of Pittsburgh - Case of the month http://path.upmc.edu/cases/dxindex.html http://path.upmc.edu/cases/dxindex.html - WebPath - Organ System Pathology Images http://www-medilab.med.utah.edu/WebPath/ORGAN.htm http://www-medilab.med.utah.edu/WebPath/ORGAN.htm - The Telepathology Archive - AFIP http://www.afip.org/homes/bethetele/index.html http://www.afip.org/homes/bethetele/index.html addendum

28 SiguienteAnterior Lista de Recursos y sus URL - Tumorboard http://www.tumorboard.com http://www.tumorboard.com - Atlas of Liver Pathology - University Iowa http://www.vh.org/Providers/Textbooks/LiverPathology/Text/AtlasLiverPathology.html http://www.vh.org/Providers/Textbooks/LiverPathology/Text/AtlasLiverPathology.html - Dermatology Image Bank http://www-medlib.med.utah.edu/kw/derm http://www-medlib.med.utah.edu/kw/derm - On-line Atlas of Derrmatology and Rheumatology http://www.archrheumatol.net/atlas/index.htm http://www.archrheumatol.net/atlas/index.htm - Hematology Image Atlas http://hms.medweb.harvard.edu/HS_Heme/AtlasTOC.htm http://hms.medweb.harvard.edu/HS_Heme/AtlasTOC.htm - Atlas of Hematology Nagoya University School of Medicine http://pathy.med.nagoya- u.ac.jp/pathy/Pictures/atlas.htmlhttp://pathy.med.nagoya- u.ac.jp/pathy/Pictures/atlas.html - 6º Curso de Hematopatología - Tortosa http://www.conganat.org/linfo.tortosa/6curso/seminarios/index.asp http://www.conganat.org/linfo.tortosa/6curso/seminarios/index.asp addendum

29 SiguienteAnterior Lista de Recursos y sus URL - Public Health Image Library, CDC, Atlanta, GA http://phil.cdc.gov/Phil/default.asp http://phil.cdc.gov/Phil/default.asp - Atlas of Medical Parasitology http://www.cdfound.to.it/default.htm http://www.cdfound.to.it/default.htm - Pathconsult -- Case Report -- Reference Data Base http://pathconsult.imag.fr/EUROPATH/ - http://europath.imag.fr/Tools/RDB/index0.htm http://pathconsult.imag.fr/EUROPATH/ http://europath.imag.fr/Tools/RDB/index0.htm - BioImage Date Base http://www.bioimage.org/database/webdriver http://www.bioimage.org/database/webdriver - Casos Clínico-Patológicos - Anatomía Patológica de Orense http://www.cristalp.es/docencia/seccion1.htm http://www.cristalp.es/docencia/seccion1.htm - Comunidad Virtual de Anatomía Patológica http://www.conganat.orghttp://www.conganat.org - Proyecto Eusalud y Atlas Interactivo de Urología http://www.eusalud.net - http//eusalud.uninet.edu - http://www.uroatlas.net http://www.eusalud.nethttp//eusalud.uninet.edu http://www.uroatlas.net addendum